来自研究'尼曼-匹克C型蛋白在刺胞动物-甲藻内共生中是否起关键作用?'的数据
该数据集包含海葵Anemonia viridis中尼曼-匹克C型蛋白(NPC1和NPC2)的基因序列、表达数据和免疫组织化学图像等多模态数据,主要研究这些蛋白在刺胞动物与甲藻内共生关系中的作用,特别是它们在维持共生稳定性及环境压力导致共生破裂过程中的功能机制,为海洋共生生物学和疾病相关蛋白研究提供实验依据。
基本信息
资源简介
该数据集来源于一项关于尼曼-匹克C型蛋白(NPC1和NPC2)在刺胞动物(如海葵)与甲藻(Symbiodinium)内共生关系中作用的研究。数据包括海葵Anemonia viridis中NPC1和NPC2基因的序列、表达水平(如qPCR结果)、免疫组织化学定位图像,以及在不同共生状态(如正常、应激、共生破裂)下的基因表达变化。这些数据通过实验方法(如基因克隆、表达分析、免疫标记)构建,主要用于探究宿主-共生体识别、代谢交换及共生稳定性维持的细胞机制,特别是在环境压力导致共生破裂(白化)过程中的作用,对理解珊瑚礁生态系统的共生生物学和疾病相关蛋白功能具有重要价值。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://search.dataone.org/view/null
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项关于尼曼-匹克C型蛋白(NPC1和NPC2)在刺胞动物(如海葵)与甲藻(Symbiodinium)内共生关系中作用的研究。数据包括海葵Anemonia viridis中NPC1和NPC2基因的序列、表达水平(如qPCR结果)、免疫组织化学定位图像,以及在不同共生状态(如正常、应激、共生破裂)下的基因表达变化。这些数据通过实验方法(如基因克隆、表达分析、免疫标记)构建,主要用于探究宿主-共生体识别、代谢交换及共生稳定性维持的细胞机制,特别是在环境压力导致共生破裂(白化)过程中的作用,对理解珊瑚礁生态系统的共生生物学和疾病相关蛋白功能具有重要价值。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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