MEN1胃肠胰神经内分泌肿瘤microRNA调控网络数据集
该数据集包含MEN1(多发性内分泌腺瘤病1型)胃肠胰神经内分泌肿瘤病例的microRNA表达数据与生物信息学分析结果,数据模态包括基因表达计数表格和差异表达分析、基因集富集分析(GSEA)的统计结果表格,主要用于研究MEN1相关肿瘤中microRNA的调控网络、差异表达模式及其在肿瘤发生发展中的作用,为肿瘤生物学和表观遗传调控研究提供数据支持。

基本信息
资源简介
MEN1胃肠胰神经内分泌肿瘤microRNA调控网络数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《miRRN_MEN1_GEP_NT》。源站首次发布:2021-11-24。
【数据内容】
源站原始描述:"MicroRNAs Regulatory Network governing the epigenetic landscape of MEN1 gastroenteropancreatic neuroendocrine tumour: a case report." SUPPLEMENTARY DATA TABLES Table 1: Raw_miRNA_counts.xls Table containing all the raw mature miRNA counts (according to miRBase 22.1) of the samples used in the current study. Table 2: Tumour_vs_Ctrl.xls Table containing the output results of differential expression analysis performed with DESeq2 by comparing tumour (gastrinomas+pNETs) and control MEN1 pancreas. R…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个,合计 1.26 MB。数据集 DOI:10.17632/wfm74g24d7.1。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/wfm74g24d7
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/wfm74g24d7
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项关于MEN1(多发性内分泌腺瘤病1型)胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NET)中microRNA调控网络与表观遗传景观的病例研究报告。数据集包含五个补充数据表格:Table 1为所有样本的原始成熟microRNA计数数据(基于miRBase 22.1);Table 2至Table 4分别展示了使用DESeq2进行差异表达分析的结果,比较了肿瘤样本(胃泌素瘤和pNETs)与对照MEN1胰腺组织;Table 5包含了通过miRWalk 3.0对microRNA调控网络枢纽的预测靶点进行基因集富集分析(GSEA)的结果。数据来源于公开的病例研究,主要用于研究MEN1相关肿瘤中microRNA的表达谱、差异表达模式及其潜在的调控网络,为理解该疾病的分子机制和寻找潜在生物标志物提供支持。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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