炎症性肠病患者外周血白细胞纵向全基因组DNA甲基化图谱

资源简介

炎症性肠病患者外周血白细胞纵向全基因组DNA甲基化图谱

Methylation_PBL_IBD_LTS 是一个聚焦于炎症性肠病（IBD）的 DNA 甲基化数据集，来源于 omicsdi.org，归属于消化系统疾病 / 炎症性肠病分类。该数据集的核心内容是对炎症性肠病患者外周血白细胞（PBL）进行纵向全基因组 DNA 甲基化图谱分析，覆盖克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）两类主要 IBD 亚型，并在两个不同时间点分别采样。通过纵向设计，该数据集能够反映同一患者在不同时间节点上外周血白细胞甲基化状态的动态变化，为探索 IBD 的表观遗传学特征、疾病进展相关分子标志物以及潜在的治疗靶点提供数据基础。其主题标签为 Genomics，表明该数据集属于基因组学范畴，适合用于甲基化水平分析、差异甲基化区域识别及纵向比较研究。

【数据集背景】

炎症性肠病是一类以慢性肠道炎症为特征的疾病，主要包括克罗恩病和溃疡性结肠炎。近年来，表观遗传学机制，尤其是 DNA 甲基化，被认为在 IBD 的发病机制、免疫调节和疾病进程中发挥重要作用。外周血白细胞作为易于获取的临床样本，其甲基化谱能够反映机体免疫状态和系统性炎症变化。该数据集正是在这一背景下产生，旨在通过纵向全基因组 DNA 甲基化分析，揭示 IBD 患者外周血白细胞的表观遗传动态。源站描述明确指出，该数据集针对 IBD 患者（包括 CD 和 UC）的 PBL 进行纵向全基因组 DNA 甲基化分析，采样时间点有两个。

【数据内容】

该数据集提供的是全基因组 DNA 甲基化图谱，样本类型为外周血白细胞（PBL），研究对象为炎症性肠病患者，涵盖克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）两种亚型。数据具有纵向特征，即来自同一患者群体在两个不同时间点分别采集样本并完成甲基化检测。主题标签为 Genomics。除上述信息外，关于具体样本数量、甲基化位点数量、测序深度、平台型号、数据文件格式等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述，其采集对象为 IBD 患者的外周血白细胞，患者类型包括 CD 和 UC，采样时间点为两个不同时间点。关于具体的采集机构、地理区域、伦理审批信息、样本纳入与排除标准、采样间隔时长等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于炎症性肠病相关的表观遗传学研究，尤其是需要分析外周血白细胞 DNA 甲基化纵向变化的研究场景。潜在应用包括：比较 CD 与 UC 患者在不同时间点的甲基化谱差异；识别与疾病活动或进展相关的差异甲基化区域；探索 IBD 的潜在表观遗传生物标志物；以及作为基因组学研究中甲基化数据整合分析的资源。由于数据具有纵向特征，也可用于研究同一患者个体内甲基化随时间的变化模式。但具体适用性需结合数据实际质量和样本量判断，源站未提供相关验证信息。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、预处理流程、归一化方法、分析工具推荐、质量控制标准等。用户如需使用，应参考 omicsdi.org 上该数据集的原始页面或相关数据说明。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、批次效应、样本量、测序覆盖度、甲基化 calling 置信度等方面的信息。已知限制包括：仅涉及外周血白细胞，不能直接反映肠道局部组织的甲基化状态；仅包含 CD 和 UC 两类 IBD 患者，未提及是否包含健康对照；纵向时间点仅为两个，可能不足以刻画完整的动态轨迹。其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或数据共享政策。用户在使用前应自行查阅 omicsdi.org 上该数据集的原始页面以获取相关授权和引用要求。