小鼠肠道宏基因组

该数据集为小鼠肠道宏基因组数据,来源于 omicsdi.org,分类属于消化系统疾病中的脂肪肝(MASLD)。源站描述显示其内容为经 Aspergillus chevalieri JH0001 处理的 NAFLD 小鼠的肠道微生物组

omicsdi
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基因组分类Genomics
mouse gut metagenome

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

小鼠肠道宏基因组

该数据集为小鼠肠道宏基因组数据,英文名称为 mouse gut metagenome,来源于 omicsdi.org,在分类上属于消化系统疾病中的脂肪肝(MASLD)方向。根据源站描述,其内容为经 Aspergillus chevalieri JH0001 处理的 NAFLD 小鼠的肠道微生物组。数据集主题标签为 Genomics,表明其核心数据类型与基因组学相关。整体来看,该数据集围绕 NAFLD 小鼠模型在特定真菌处理条件下的肠道微生物组成展开,可用于探索肠道菌群与脂肪肝疾病之间可能存在的关联,并为相关研究提供宏基因组层面的数据基础。

【数据集背景】

该数据集聚焦于消化系统疾病中的脂肪肝(MASLD)方向。源站描述指出,其研究对象为 NAFLD 小鼠,并涉及 Aspergillus chevalieri JH0001 处理。NAFLD 即非酒精性脂肪性肝病,属于常见的慢性肝脏疾病范畴,而 MASLD 是与之相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病概念。该数据集以小鼠肠道宏基因组为切入点,试图呈现经 Aspergillus chevalieri JH0001 处理后 NAFLD 小鼠肠道微生物组的情况。关于该研究的具体实验背景、立项依据、研究假设及更详细的疾病模型构建方式,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容为小鼠肠道宏基因组数据。源站描述明确其内容为经 Aspergillus chevalieri JH0001 处理的 NAFLD 小鼠的肠道微生物组。主题标签为 Genomics,说明数据与基因组学相关。就数据的具体组成而言,例如包含哪些样本、测序深度、序列读长、物种注释信息、功能注释信息、丰度表或原始测序文件等,源站未提供。数据是否包含对照组、处理组的具体分组信息,以及是否包含宿主基因组信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述显示,其研究对象为经 Aspergillus chevalieri JH0001 处理的 NAFLD 小鼠的肠道微生物组。关于样本采集的具体部位、采集时间、小鼠品系、饲养条件、处理剂量与周期、测序平台、建库方法及数据处理流程等细节,源站未提供。数据集的原始提交机构、作者信息及所属项目信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与小鼠肠道宏基因组相关的研究场景,尤其是围绕 NAFLD 及 MASLD 方向、关注肠道微生物组变化的研究。由于源站描述提及 Aspergillus chevalieri JH0001 处理,该数据集也可能用于探索特定真菌干预条件下 NAFLD 小鼠肠道微生物组的组成特征。此外,主题标签为 Genomics,提示其可用于基因组学相关的分析或比较研究。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发、生物标志物筛选等具体应用,源站未提供,不应据此推断。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取或检索。关于具体的数据下载方式、文件格式、数据量大小、是否提供预处理数据或原始数据、是否需要特定分析工具或流程、是否提供使用说明文档等,源站未提供。使用者在获取数据后,应根据实际获得的数据类型和分析目标,选择相应的宏基因组分析流程。由于源站未提供详细的使用指南,建议在使用前先确认数据的具体内容与格式。

【质量与限制】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述为其内容为经 Aspergillus chevalieri JH0001 处理的 NAFLD 小鼠的肠道微生物组。关于数据质量,例如测序质量、污染控制、批次效应、样本量大小、重复设置、统计效力及数据完整性等,源站未提供。该数据集基于小鼠模型,其结果能否外推到人类 NAFLD 或 MASLD 患者,源站未提供相关说明。此外,数据仅涉及特定处理条件,是否可推广至其他真菌处理或其他 NAFLD 模型,源站未提供。使用者在解释结果时应考虑模型系统与人类疾病之间的差异。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、是否允许商业用途、是否需要署名及是否可再分发等,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前,应自行查阅来源站 omicsdi.org 上的相关说明,或联系数据提供方以确认具体的引用格式与许可条款。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1481363

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gut microbiota of NAFLD mice treated with Aspergillus chevalieri JH0001

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