D3与D0差异表达基因数据集
该数据集以基因表达数据（文本/表格模态）为核心，包含D3与D0时间点间差异表达基因的TPM值，通过RNA测序技术获得，重点关注羊水中细胞因子表达谱及其对食管上皮细胞分化和过敏反应基因（如CCL26和CAPN14）的调控作用，主要用于研究妊娠期环境因素与遗传互作在嗜酸性食管炎等过敏性疾病发病机制中的影响，为食管上皮生物学和胎儿编程研究提供分子层面的数据支持。
创建时间2024-08-13
更新时间2024-08-13
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Suppl_Table_3_D3_vs_D0_FDR_05_FC2_TPM_xlsx/26603920/1
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资源简介
该数据集来源于一项研究羊水对食管上皮细胞分化及过敏反应影响的研究，主要包含D3与D0时间点之间差异表达基因的TPM（每百万转录本数）数据，筛选条件为错误发现率（FDR）<0.05且倍数变化（FC）≥2。数据通过RNA测序获得，涉及66种细胞因子的表达分析，重点关注IL-4、TSLP、TNFα、IL-12及EGF等因子在早产与足月羊水中的表达差异。研究揭示了羊水通过调节ERK1/2信号通路和早期反应基因转录，影响食管上皮细胞分化程序，并增强IL-13靶基因（如CCL26和CAPN14）的表达，其中CAPN14作为嗜酸性食管炎的主要遗传易感位点，在早产羊水暴露后显著上调。该数据集适用于研究妊娠期环境因素与遗传互作在过敏性疾病（如嗜酸性食管炎）发病机制中的作用，为食管上皮生物学和胎儿编程研究提供关键分子数据。
提供机构：Rothenberg, Marc; Rochman, Mark
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