嗜酸性食管炎儿童食管黏膜活检的Nanostring nCounter human miRNA检测数据

数据覆盖儿童嗜酸性食管炎与对照组的食管黏膜组织,可用于比较两组间microRNA表达差异,支持疾病相关microRNA标志物探索与发病机制研究(来源 BioStudies)

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浏览 7
基因组分类otherHomo sapiens
Nanostring nCounter human miRNA assay (v1) of eosinophilic esophagitis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

嗜酸性食管炎儿童食管黏膜活检的Nanostring nCounter human miRNA检测数据

该数据集为 Nanostring nCounter 人 microRNA 检测(v1 版)在嗜酸性食管炎研究中的应用数据,来源于 ebi.ac.uk,归类于消化系统疾病 / 嗜酸性食管炎方向。数据覆盖儿童嗜酸性食管炎患者与对照组的食管黏膜活检组织,通过对个体食管黏膜样本进行 microRNA 检测,获得两组样本的 microRNA 表达信息。该数据可用于比较嗜酸性食管炎患儿与对照组之间 microRNA 表达的差异,支持疾病相关 microRNA 标志物的探索以及发病机制层面的研究,主题标签涉及其他类别与 Homo sapiens。整体而言,该数据集为儿童嗜酸性食管炎黏膜 microRNA 表达谱研究提供了可用的检测数据基础。

【数据集背景】

嗜酸性食管炎是一种与食管黏膜炎症相关的消化系统疾病,其分子层面的改变是理解疾病发生发展的重要切入点。microRNA 作为一类参与基因表达调控的小分子 RNA,在炎症与免疫相关疾病中的作用受到关注。该数据集以儿童嗜酸性食管炎患者和对照人群的食管黏膜活检组织为对象,采用 Nanostring nCounter 人 microRNA 检测(v1 版)平台进行 microRNA 检测,旨在从黏膜组织的 microRNA 表达层面刻画疾病状态与对照状态之间的差异,为后续标志物筛选和机制探讨提供数据支撑。

【数据内容】

数据内容围绕食管黏膜活检样本的 microRNA 检测结果展开,样本来自儿童嗜酸性食管炎患者与对照组。检测采用 Nanostring nCounter 人 microRNA 检测(v1 版),对个体食管黏膜活检组织中的 microRNA 进行检测。数据集的主题标签包括其他类别与 Homo sapiens,表明数据涉及人类样本。数据所覆盖的生物学对象为儿童嗜酸性食管炎与对照组的食管黏膜组织,核心信息为两组样本的 microRNA 检测结果,可用于组间表达差异的比较分析。关于样本数量、具体 microRNA 种类、表达矩阵的详细构成等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。根据源站描述,数据来自儿童嗜酸性食管炎患者与对照组的个体食管黏膜活检组织,对这些样本进行 microRNA 检测分析。样本类型为食管黏膜活检组织,研究对象为儿童人群,分组包括嗜酸性食管炎患者与对照组。除上述来源与样本采集对象信息外,关于采集地点、采集时间、伦理审批及具体处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据适用于比较儿童嗜酸性食管炎患者与对照组食管黏膜组织之间 microRNA 表达差异的研究场景,可用于探索与疾病相关的 microRNA 标志物,也可为嗜酸性食管炎发病机制研究提供黏膜 microRNA 表达层面的数据参考。此外,该数据可作为消化系统疾病特别是嗜酸性食管炎相关分子研究的辅助数据资源,支持对疾病状态与对照状态进行分子层面比较的分析工作。

【使用方法】

使用时可围绕嗜酸性食管炎组与对照组之间的 microRNA 检测结果开展组间比较,识别两组间表达存在差异的 microRNA,并在此基础上进行标志物探索或机制相关的分析。由于数据基于 Nanostring nCounter 人 microRNA 检测(v1 版)平台产生,分析时应结合该检测平台的特点理解数据。关于具体的数据格式、预处理步骤、归一化方法及分析流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于儿童嗜酸性食管炎与对照组的食管黏膜活检样本,样本类型与检测平台明确。但关于样本量、数据完整性、质控指标、批次信息及可能的混杂因素等,源站未提供,因此在使用时对数据质量的评估需依据源站进一步信息。此外,数据仅涉及 microRNA 检测层面,未提供其他组学或临床信息的说明,相关限制信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中提及 BioStudies。关于具体的引用方式、许可条款及使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-55794

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Calies Menard-Katcher; Adam Zahm; Josh Friedman (2014). Nanostring nCounter human miRNA assay (v1) of eosinophilic esophagitis [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-55794

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