20只Peromyscus leucopus与20只Mus musculus血浆LPS或对照的非靶向代谢组分子特征数据
作为人畜共患病病原体天然储存宿主的动物，通常对它们持续携带的病原体表现出很少的疾病。这种感染耐受的机制及其权衡代价尚不清楚
基本信息
资源简介
20只Peromyscus leucopus与20只Mus musculus血浆LPS或对照的非靶向代谢组分子特征数据
该数据集为一项比较免疫学研究的非靶向代谢组学分子特征数据，覆盖20只白足鹿鼠（Peromyscus leucopus）与20只小家鼠（Mus musculus）在脂多糖（LPS）处理或对照条件下的血浆样本。研究以单剂量LPS内毒素暴露作为炎症实验模型，在注射LPS或生理盐水4小时后采集血液、脾脏与肝脏组织，并开展RNA-seq、非靶向代谢组学及特异性RT-qPCR检测，随后在基因、通路与经验网络层面进行差异表达分析。数据集聚焦于两类啮齿动物对炎症刺激的代谢响应差异，为理解人畜共患病病原体天然储存宿主的感染耐受机制及其权衡代价提供分子层面的观测素材。本站将其归类于消化系统疾病/其他类别，数据来源于search.dataone.org。
【数据集背景】
作为人畜共患病病原体的天然储存宿主，许多动物对自身持续携带的病原体通常表现出很少的疾病症状，即具有较高的感染耐受性。然而，这种感染耐受背后的机制以及与之相伴的权衡代价，目前仍缺乏充分认识。为在受控实验条件下考察这一问题，研究采用单剂量脂多糖（LPS）内毒素暴露作为炎症模型，将白足鹿鼠（Peromyscus leucopus）——一种具有人畜共患病病原体天然储存宿主背景的仓鼠科啮齿动物——与标准实验室致病机制研究模型小家鼠（Mus musculus）进行比较。该数据集正是这一比较研究框架下产生的血浆非靶向代谢组学分子特征数据。
【数据内容】
数据集记录的是20只白足鹿鼠与20只小家鼠在LPS处理或对照条件下血浆样本的非靶向代谢组学分子特征。研究在注射LPS或生理盐水4小时后进行死后采样，收集血液、脾脏与肝脏组织，并对这些样本开展RNA-seq、非靶向代谢组学以及特异性RT-qPCR检测。代谢组学部分以非靶向方式获取血浆中的分子特征，作为整体多组学分析的一环，与基因表达数据共同支撑后续在基因、通路与经验网络层面的差异表达分析。源站描述提到，白足鹿鼠在LPS暴露后表现出与小家鼠相同的疾病体征，这为在相似表型背景下比较两物种的代谢响应提供了前提。
【采集与来源】
样本来自白足鹿鼠与小家鼠两组动物，每组均包含LPS处理与对照两种条件，合计20只白足鹿鼠与20只小家鼠。实验采用单剂量LPS内毒素暴露作为炎症刺激，对照条件对应生理盐水注射。注射后4小时实施死后采样，获取血液、脾脏与肝脏组织，其中血浆用于非靶向代谢组学分子特征检测。数据经search.dataone.org来源站发布，本站分类为消化系统疾病/其他。除上述信息外，源站未提供更详细的采样地点、时间跨度与仪器参数。
【适用场景】
该数据集适用于比较免疫学与感染耐受机制研究，尤其是围绕人畜共患病病原体天然储存宿主为何对持续携带的病原体表现出较低疾病负担这一科学问题。具体可用于比较白足鹿鼠与小家鼠在LPS诱导炎症后血浆代谢分子特征的异同，并与同一研究中的RNA-seq与RT-qPCR结果联合分析，在基因、通路与经验网络层面考察差异表达。也可作为非靶向代谢组学方法在野生动物与实验室模型比较研究中的应用示例。
【使用方法】
使用时可依据物种（白足鹿鼠与小家鼠）和处理条件（LPS与对照）对样本进行分组，围绕血浆非靶向代谢组学分子特征开展组间比较，并与同一研究框架下的转录组与靶向qPCR结果进行整合，以在基因、通路与网络层面解释代谢差异。由于源站未提供具体的分子特征注释、定量矩阵格式与分析流程细节，实际分析前需参照来源站提供的原始文档确认数据结构与预处理方式。
【质量与限制】
源站未提供样本量以外的重复设置、质控样本、内标、检出限、缺失值比例等质量相关信息，也未提供代谢物注释置信度与定量精度指标。数据集样本规模为每组物种20只动物，且同时包含处理与对照条件，具体每条件样本数源站未提供。研究聚焦于注射后4小时这一单一时间点，时间动态信息有限。上述限制在使用与解释结果时需加以考虑。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
作为人畜共患病的天然储存宿主，动物通常对其持续携带的病原体仅表现出轻微的病态。这种感染耐受的机制及其权衡代价尚不清楚。我们采用单剂量脂多糖（LPS）内毒素暴露作为炎症的实验模型，比较白足鼠（Peromyscus leucopus，一种仓鼠科啮齿动物）与标准实验室致病机制研究模型小鼠（Mus musculus）的反应。在注射LPS或生理盐水四小时后，死后采集血液、脾脏和肝脏组织，进行RNA-seq、非靶向代谢组学和特异性RT-qPCR检测。随后在基因、通路和经验网络水平上分析差异表达。白足鼠表现出与LPS暴露小鼠相同的疾病体征，并且此外还显示出皮质酮水平和in…表达的相当增加。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
