小鼠CCl4肝损伤单细胞RNA测序图谱Seurat与Loupe对象
该数据集提供了C57BL/6小鼠在四氯化碳（CCl₄）损伤后肝脏单核吞噬细胞的综合单细胞RNA测序图谱。样本覆盖未损伤肝脏与血液，以及损伤后24小时、96小时和4周三个时间点的肝脏与血液
基本信息
资源简介
小鼠CCl4肝损伤单细胞RNA测序图谱Seurat与Loupe对象
该数据集提供了C57BL/6小鼠在四氯化碳（CCl₄）损伤后肝脏单核吞噬细胞的综合单细胞RNA测序图谱。样本覆盖未损伤肝脏与血液，以及损伤后24小时、96小时和4周三个时间点的肝脏与血液。图谱鉴定出17种转录组上不同的细胞状态，并以Seurat对象（.rds）和Loupe对象（.loupe）两种格式提供，分别用于R下游分析和交互式可视化。可用于研究慢性肝病、肝纤维化中瘢痕相关巨噬细胞及炎症相关的免疫细胞状态与动态（来源 datashare.ed.ac.uk）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含一份全面的单细胞RNA测序（scRNA-seq）图谱，对象为四氯化碳（CCl₄）损伤后C57BL/6小鼠肝脏中的单核吞噬细胞。对于scRNA-seq分析，在最后一次CCl₄注射后24小时、96小时和4周收集血液和肝脏组织。该数据集整合了来自三个未损伤肝脏样本、三个未损伤血液样本以及三个损伤时间点（24小时、96小时和4周）收集的CCl₄损伤肝脏和血液样本的scRNA-seq图谱。该图谱鉴定出小鼠单核吞噬细胞的17种转录组上不同的细胞状态，并以两种格式提供：用于R下游分析的Seurat对象（.rds）和用于交互式可视化的Loupe对象（.loupe）。
【主题与分类】
主题标签：Chronic liver disease、Liver fibrosis、Single-cell RNA-seq、Mouse CCl4 Liver atlas、Scar-associated macrophages (SAMacs)、OLR1、Inflammation、liver immunology。本站分类：消化系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/9255
下载信息
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数据集获取
源站：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/9255
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含C57BL/6小鼠在四氯化碳（CCl₄）损伤后肝脏单核吞噬细胞的全面单细胞RNA测序（scRNA-seq）图谱。对于scRNA-seq分析，在最后一次CCl₄注射后的24小时、96小时和4周时收集了血液和肝组织。该数据集整合了来自三个未损伤肝脏样本、三个未损伤血液样本以及在三个损伤时间点（24小时、96小时和4周）收集的CCl₄损伤肝脏和血液样本的scRNA-seq图谱。该图谱鉴定了小鼠单核吞噬细胞的17种转录上不同的细胞状态，并以两种格式提供：用于R中下游分析的Seurat对象（.rds）和用于交互式可视化的Loupe对象（.loupe）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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