非洲农村人群肝功能检测与纤维化评分数据集

该数据集来自 figshare,用于支持对乌干达农村人群肝病患病率与病因的分析。数据于 2011 年采集自乌干达西南部 Kalungu 区 Kyamulibwa 的 Uganda General Population Cohort(GPC),基于肝功能检测(LFTs)与纤维化评分评估肝病患病率,并估

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2021-03-09 更新
浏览 6
表格分类liver function testsliver diseasehepatitishbvhepatitis b virushivalcoholalcoholic liver diseaseafricaugandaprevalenceepidemiology
Liver function tests and fibrosis scores in a rural population in Africa

基本信息

模态
表格
大小
0.003745127 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2021-03-09
版本
v3

资源简介

非洲农村人群肝功能检测与纤维化评分数据集

Liver function tests and fibrosis scores in a rural population in Africa

该数据集来自 figshare,用于支持对乌干达农村人群肝病患病率与病因的分析。数据于 2011 年采集自乌干达西南部 Kalungu 区 Kyamulibwa 的 Uganda General Population Cohort(GPC),基于肝功能检测(LFTs)与纤维化评分评估肝病患病率,并估计与酒精、乙型肝炎病毒(HBV)、HIV 及高或低体重指数相关的肝病负担。文件包含分析所用的完整元数据表(xls 与 csv)以及 STROBE 声明和补充材料,可用于肝病流行病学分析与研究复现(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:Wellcome Trust, 110110 to Philippa Matthews; UK Medical Research Council to the Uganda General Population Cohort。源站首次发布:2021-03-09。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):这是一个数据集,用于支持一项分析,以估计乌干达农村人群肝病的患病率和病因。数据于 2011 年采集自 Uganda General Population Cohort(GPC),该队列位于乌干达西南部 Kalungu 区的 Kyamulibwa,成立于 1989 年(合作伙伴:UK Medical Research Council、Uganda Virus Research Institute、London School of Hygiene and Tropical Medicine)。我们基于肝功能检测(LFTs)和纤维化评分评估了肝病患病率,并估计了与酒精、乙型肝炎病毒(HBV)、HIV 以及高或低体重指数相关的肝病负担。此处包含的文件如下:1. 支撑分析的完整元数据,标记为“GPC metadata table”,以 xls 和 csv 文件提供。2. STROBE 声明(STrengthening the Reporting of OBservational studies in Epidemiolog

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 3.75 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.8292194.v3。

【主题与分类】

源站学科分类:Gastroenterology and hepatology、Medical virology、Medical infection agents (incl. prions)。主题标签:liver function tests、liver disease、hepatitis、hbv、hepatitis b virus、hiv、alcohol、alcoholic liver disease、africa、uganda。本站分类:消化系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gastroenterology and hepatology、Medical virology、Medical infection agents (incl. prions)。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Liver_function_tests_and_fibrosis_scores_in_a_rural_population_in_Africa/8292194

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:O’Hara, Geraldine; Mokaya, Jolynne; Hau, Jeffrey; Downs, Louise; Karabarinde, Alex; Asiki, Gershim; et al. (2019). Liver function tests and fibrosis scores in a rural population in Africa. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "GPC metadata table.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/15534986"
curl -L -o "GPC metadata table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/15534989"
curl -L -o "191219 STROBE checklist LFTs study.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/20291433"
curl -L -o "191216_2 LFTs paper SUPPLEMENTARY MATERIAL.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/26754413"

文件清单

  • GPC metadata table.csv(1.31 MB)
  • GPC metadata table.xlsx(1.80 MB)
  • 191219 STROBE checklist LFTs study.pdf(102.86 KB)
  • 191216_2 LFTs paper SUPPLEMENTARY MATERIAL.pdf(532.83 KB)

文件总体积 3.75 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

这是一个数据集,用于支持一项分析,以估计乌干达农村人群中肝病的患病率和病因。数据于2011年采集自乌干达一般人群队列(GPC),该队列位于乌干达西南部卡隆古区的Kyamulibwa,成立于1989年(合作方:英国医学研究理事会、乌干达病毒研究所、伦敦卫生与热带医学院)。

我们基于肝功能检查(LFTs)和纤维化评分评估了肝病的患病率,并估计了与酒精、乙型肝炎病毒(HBV)、HIV以及高或低体重指数相关的肝病负担。

此处包含的文件如下:

  1. 支持该分析的完整元数据,标记为“GPC元数据表”,以xls和csv文件提供。

  2. STROBE声明(加强流行病学观察性研究报告)

  3. 一份包含补充材料(表格和图表)的pdf文档,具体如下:

补充表1:肝功能检查(LFTs)的来源、参考范围和临床意义

补充表2:用于估计肝纤维化的评分,根据肝功能检查计算

补充表3:来自乌干达一般人群队列(N=8,099)具有肝功能检测(LFT)结果的研究参与者特征描述

补充表4:按危险因素对人群分组后各项肝功能检测的中位数及四分位距

补充图1:乌干达一般人群队列中肝功能检测的分布。

补充图2:按性别和年龄分组的参与者中ALT、AST、APRI、GPR及AST/ALT异常的比值比。

补充图3:乌干达一般人群队列中AST/ALT比值>2与≤2个体报告饮酒的比例

补充图4:乌干达一般人群队列中按AST/ALT比值分组的GGT升高比例。(A)男性,GGT正常上限=61(B)女性,GGT正常上限=36。P值采用Fisher精确检验

补充图5:乌干达一般人群队列中按GPR评分分组的血源性病毒感染(BBV)比例。P值采用Fisher精确检验,

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.8292194.v3(source: https://figshare.com/articles/dataset/Liver_function_tests_and_fibrosis_scores_in_a_rural_population_in_Africa/8292194)。

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