缺氧与常氧条件下人瘢痕疙瘩成纤维细胞外泌体microRNA表达谱

该数据集来自NCBI GEO,对人瘢痕疙瘩成纤维细胞在缺氧(3% O2)与常氧(20% O2)条件下分泌的外泌体进行small RNA测序,共6个样本(缺氧组D1-D3、常氧组C1-C3),鉴定出27个差异表达miRNA,其中miR-29a-3p在缺氧组外泌体中显著上调,并进一步研究其通过靶向VAS

geo
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基因组分类GPL167919606
GSE348938: MicroRNA expression profiling of exosomes derived from human keloid fibroblasts under hypoxic and normoxic conditions

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

缺氧与常氧条件下人瘢痕疙瘩成纤维细胞外泌体microRNA表达谱

MicroRNA expression profiling of exosomes derived from human keloid fibroblasts under hypoxic and normoxic conditions

该数据集来自NCBI GEO,对人瘢痕疙瘩成纤维细胞在缺氧(3% O2)与常氧(20% O2)条件下分泌的外泌体进行small RNA测序,共6个样本(缺氧组D1-D3、常氧组C1-C3),鉴定出27个差异表达miRNA,其中miR-29a-3p在缺氧组外泌体中显著上调,并进一步研究其通过靶向VASH1促进内皮细胞增殖、迁移和成管的功能。数据可用于非编码RNA表达谱分析、差异miRNA筛选及瘢痕疙瘩血管生成机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 29 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在探究瘢痕疙瘩成纤维细胞(KFs)来源的外泌体miRNA在促进血管生成和瘢痕疙瘩形成中的作用。原代KFs在缺氧(3% O2)和常氧(20% O2)条件下培养,并从条件培养基中分离外泌体。对这些外泌体进行small RNA测序以鉴定差异表达miRNA。共分析6个样本,包括缺氧组3个生物学重复(D1-D3,Hypoxic-KFs-exo)和常氧组3个(C1-C3,Normoxic-KFs-exo)。我们鉴定出27个差异表达miRNA,其中miR-29a-3p在缺氧KFs-exo中显著上调。进一步的功能和机制研究表明,外泌体miR-29a-3p被递送至人脐静脉内皮细胞(HUVECs),直接靶向VASH1以促进内皮增殖、迁移和成管

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348938

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 03 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究瘢痕疙瘩成纤维细胞(KFs)来源的外泌体miRNA在促进血管生成及瘢痕疙瘩形成中的作用。原代KFs在缺氧(3% O2)和常氧(20% O2)条件下培养,并从条件培养基中分离外泌体。对这些外泌体进行小RNA测序以鉴定差异表达的miRNA。共分析6个样本,包括缺氧组的3个生物学重复(D1-D3,Hypoxic-KFs-exo)和常氧组的3个生物学重复(C1-C3,Normoxic-KFs-exo)。我们鉴定出27个差异表达的miRNA,其中miR-29a-3p在缺氧KFs-exo中显著上调。进一步的功能和机制研究表明,外泌体miR-29a-3p被递送至人脐静脉内皮细胞(HUVECs)中,直接靶向VASH1以促进内皮细胞增殖、迁移和管腔形成,最终增强瘢痕疙瘩进展中的血管生成。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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