内皮Matrin-3限制细胞衰老与脂质失调以对抗小鼠动脉粥样硬化 [snRNA-seq]

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335389

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数据说明

Matrin-3是一种DNA和RNA结合蛋白，其在小鼠和人类中的功能缺失与二叶式主动脉瓣、主动脉缩窄及动脉导管未闭相关。然而，内皮细胞matrin-3在动脉粥样硬化中的作用此前尚未被研究。本研究通过bulk RNA测序在人内皮细胞中鉴定出数百个差异表达基因。生物信息学分析显示，富集的通路涉及DNA复制、p53信号传导、细胞周期和细胞衰老。在小鼠动脉粥样硬化模型中，内皮细胞特异性matrin-3缺失导致动脉粥样硬化病变面积增加35.7%，且不依赖于巨噬细胞浸润，同时伴有血浆低密度脂蛋白胆固醇和甘油三酯水平升高、肝脏总胆固醇和甘油三酯水平升高以及主动脉内膜转录组改变。单核RNA测序显示，内皮细胞matrin-3缺失损害肝细胞信号传导并促进炎症。最后，matrin-3在小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的表达降低。

这些结果表明，内皮细胞中的matrin-3能够限制细胞衰老，从而通过旁分泌效应维持脂质稳态；其在血管内皮中的表达可保护小鼠免于发生动脉粥样硬化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。