GSE322724：急性-on-慢性肝衰竭中肝脏转录组变化指向代谢肝分区受损与线粒体功能障碍

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE322724

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数据说明

背景与目的：肝外器官衰竭是慢加急性肝衰竭（ACLF）的关键决定因素，进而也是肝硬化短期死亡率的关键决定因素。尽管全身性炎症和线粒体功能障碍在ACLF发病机制中的作用已广为人知，但肝脏本身的作用尚不清楚。因此，在本研究中，我们研究了ACLF与代偿性和失代偿性肝硬化相比肝脏转录组的特征。方法：对接受肝移植的代偿性肝硬化、失代偿性肝硬化或ACLF患者的肝脏标本进行了批量RNA测序和空间转录组学分析。此外，还对参与能量代谢的基因及相关底物进行了详细分析。结果：ACLF与肝脏转录组的变化相关，这些变化明显区别于代偿性和失代偿性肝硬化。在ACLF中下调最显著的是参与底物代谢和线粒体功能的通路，更具体地说，ACLF的特征是参与葡萄糖和氨基酸代谢的多个基因下调。

空间转录组学数据显示，ACLF中肝脏功能性分区遭到破坏，专门负责糖异生/β-氧化的肝细胞比例下降。在ACLF中强烈下调的BCKDK被鉴定为连接支链氨基酸代谢受损与糖代谢受损的潜在候选基因。结论：ACLF的特征是肝脏转录组发生明显变化，影响底物代谢和线粒体功能的关键通路，并与功能性肝脏分区的丧失相关。ACLF中BCKDK的下调可能特别值得关注，因为它可能将支链氨基酸代谢与糖代谢受损及线粒体功能障碍整合在一起。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。