B6-mdx与D2-mdx小鼠腓肠肌空间转录组与单细胞RNA测序数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含B6-mdx与D2-mdx两种DMD小鼠模型腓肠肌的空间转录组与单细胞RNA测序数据。研究结合免疫荧光组织学分析与空间转录组,识别具有坏死纤维、炎症细胞浸润和纤维化增加等营养不良特征的特异性肌肉组织簇,并利用单细胞RNA测序参考与空间解卷积分析各营养不良区域内的细胞

基本信息
资源简介
B6-mdx与D2-mdx小鼠腓肠肌空间转录组与单细胞RNA测序数据集
Spatial transcriptomics and scRNA-sequencing on gastrocnemius muscle form B6-mdx and D2-mdx mice
该数据集来自NCBI GEO,包含B6-mdx与D2-mdx两种DMD小鼠模型腓肠肌的空间转录组与单细胞RNA测序数据。研究结合免疫荧光组织学分析与空间转录组,识别具有坏死纤维、炎症细胞浸润和纤维化增加等营养不良特征的特异性肌肉组织簇,并利用单细胞RNA测序参考与空间解卷积分析各营养不良区域内的细胞类型与状态,发现特定细胞亚群在这些空间簇中富集。数据可用于研究DMD肌肉微环境中的细胞组成与空间异质性(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 16 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们研究了与两种人DMD小鼠模型(即B6.mdx和D2.mdx)肌肉退行性变严重程度相关的肌肉结构域的细胞类型组成。我们首先结合基于免疫荧光的组织学分析和空间转录组学,以突出显示具有营养不良特征(包括坏死纤维、炎症细胞浸润和纤维化增加)的特定肌肉组织簇。利用单细胞RNA测序参考和空间解卷积,我们分析了每个营养不良结构域内的细胞类型和状态,从而鉴定出这些空间簇中特定细胞亚群的富集。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL17021、10090。本站分类:消化系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297388
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 02 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
我们研究了与人类DMD两种小鼠模型(即B6.mdx和D2.mdx)中肌肉退变严重程度相关的肌肉区域的细胞类型组成。我们首先结合基于免疫荧光组织学分析和空间转录组学,突出了显示营养不良特征(包括坏死纤维、炎症细胞浸润和纤维化增加)的特定肌肉组织簇。利用单细胞RNA测序参考和空间去卷积,我们分析了每个营养不良区域内的细胞类型和状态,从而确定了这些空间簇中特定细胞亚群的富集。
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