perR对Clostridioides difficile 630∆erm氧敏感性、基因表达及小鼠感染的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280615

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数据说明

艰难梭菌感染（CDI）以结肠炎和腹泻为特征，每年在美国影响约五十万人，给个人和医疗系统均带来沉重负担。艰难梭菌630Δerm是临床分离株艰难梭菌630的红霉素敏感变异株，因其遗传可操作性而常被艰难梭菌研究界使用。630Δerm在perR基因中存在一个点突变，perR是一个自调控的转录抑制因子，调控氧化应激抗性基因。该点突变导致630Δerm中PerR操纵子组成性去阻遏。为探讨perR对与耐氧性相关及与CDI小鼠模型相关的表型的影响，我们修正了该点突变以恢复630Δerm中PerR的功能（本文中称为630Δerm perRWT）。我们证明，在厌氧条件下或暴露于模拟结肠上皮表面附近所发现的O2浓度时，630Δerm与630Δerm perRWT之间的生长没有差异。

然而，与630∆erm相比，630∆erm perRWT对环境氧更为敏感，这与多种perR依赖性和perR非依赖性基因表达的改变相吻合。最后，我们表明，在成熟的CDI小鼠模型中，630∆erm和630∆erm perRWT在感染和致病能力上并无差异。总之，这些数据支持以下假说：630∆erm中的perR突变是暴露于环境氧的结果，且630∆erm中的perR突变不太可能在实验室研究中影响CDI相关表型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。