GSE240720:S100A8+胃粒细胞样髓源性抑制细胞群体中Cxcr2+亚群调控胃病理

该数据集来自NCBI GEO,标题为S100A8+胃粒细胞样髓源性抑制细胞群体中Cxcr2+亚群调控胃病理,属于消化系统疾病分类

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL1740010090
GSE240720: The Cxcr2+ subset of the S100A8+ Gastric Granylocytic Myeloid-Derived Suppressor Cell Population Regulates Gastric Pathology

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

GSE240720:S100A8+胃粒细胞样髓源性抑制细胞群体中Cxcr2+亚群调控胃病理

GSE240720 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,英文标题为“The Cxcr2+ subset of the S100A8+ Gastric Granylocytic Myeloid-Derived Suppressor Cell Population Regulates Gastric Pathology”,中文可译为“S100A8+胃粒细胞样髓源性抑制细胞群体中Cxcr2+亚群调控胃病理”。该数据集归入消化系统疾病 / 其他分类,围绕胃部病理条件下特定髓源性抑制细胞亚群的基因表达特征展开,主题标签涉及芯片表达谱分析。数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干子系列构成,当前可获取的文件为一个 GZIP 压缩的系列矩阵文件。整体而言,该数据集适合关注胃粒细胞样髓源性抑制细胞异质性、Cxcr2+亚群功能以及胃病理相关表达谱的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集聚焦于胃部病理过程中的免疫细胞群体。标题明确指出研究对象为 S100A8+ 胃粒细胞样髓源性抑制细胞(Gastric Granylocytic Myeloid-Derived Suppressor Cell)群体中的 Cxcr2+ 亚群,并探讨该亚群对胃病理的调控作用。髓源性抑制细胞是一类具有免疫抑制功能的细胞群体,在炎症、感染和肿瘤等病理环境中受到关注;将其研究范围限定到 S100A8+ 群体中的 Cxcr2+ 亚群,意味着该数据集服务于细胞亚群层面的表达特征刻画。数据集所属分类为消化系统疾病 / 其他,说明其应用背景落在消化系统疾病的范畴内。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未进一步展开各子系列的具体内容。

【数据内容】

数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE240720_series_matrix.txt.gz,即一个经过 GZIP 压缩的系列矩阵文本文件。系列矩阵通常用于汇总样本层面的表达数据及其相关注释信息,但该数据集具体包含多少样本、覆盖哪些基因或探针、采用何种分组设计,源站未提供。主题标签中包含 Expression profiling by array,表明数据来自芯片表达谱分析;同时列出 GPL17400 与 10090,前者为芯片平台编号,后者对应小鼠这一物种编号,说明数据基于小鼠芯片平台产生。数据集中各样本的具体处理条件、生物学重复数量以及表达值矩阵的规模等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库,属于 GEO 中的 SuperSeries 条目。作者信息标注为 Bioinformatics,Core。发布时间记录为 Aug 11 202,年份信息不完整,源站未提供完整的发布日期。数据集的英文名与源站标题一致,均指向 Cxcr2+ 亚群调控胃病理这一研究主题。除上述来源信息外,样本采集地点、实验机构、伦理审批及具体实验流程等内容,源站未提供。

【适用场景】

基于其分类与主题,该数据集可用于消化系统疾病背景下胃粒细胞样髓源性抑制细胞亚群的表达谱研究,例如比较不同样本间整体表达模式、关注 Cxcr2+ 亚群相关基因的表达变化,或作为胃病理免疫微环境研究的参考数据。由于数据以芯片表达谱形式提供,也适合用于芯片数据的预处理、归一化与差异表达分析等方法学练习。需要强调的是,该数据集的具体样本构成与分组信息源站未提供,因此在设计具体比较分析前应先核对数据文件中的实际内容。任何超出表达谱分析范围的用途,源站未提供相应说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE240720_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包,需先解压再按文本格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认样本标识、平台注释与表达值列的含义无误后,再批量接入分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,若需追溯具体子系列的数据,应结合源站条目进一步查看,但子系列清单及内容源站未提供。分析时应注意芯片平台 GPL17400 对应的注释信息,以确保探针与基因的对应关系正确。

【质量与限制】

该数据集可获取的文件仅 1 个,且为汇总性质的系列矩阵文件,原始数据与子系列细节是否公开、样本量大小、重复设置及数据质控指标等,源站未提供。发布时间记录不完整,可能影响对数据时效性的判断。作者信息仅给出 Bioinformatics,Core,缺少更详细的贡献说明。使用者在开展分析前应自行评估数据完整性与适用性,避免在缺乏样本与分组信息的情况下作出过度推断。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI GEO,使用时应遵循源站的引用规范并注明数据集编号 GSE240720 及源站标题。具体的许可条款、使用限制与正式引用文献,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240720

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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