小鼠单纯性脂肪肝肝脏转录组数据集
该数据集为小鼠单纯性脂肪肝（NAFL）模型的肝脏转录组RNA测序数据，包含NAFL组与正常对照组小鼠肝脏全基因组mRNA表达谱
基本信息
资源简介
小鼠单纯性脂肪肝肝脏转录组数据集
Liver Transcriptomes of Simple steatosis in Mice
该数据集为小鼠单纯性脂肪肝（NAFL）模型的肝脏转录组RNA测序数据，包含NAFL组与正常对照组小鼠肝脏全基因组mRNA表达谱。研究采用高果糖高胆固醇饮食诱导12周构建模型，以FDR 2为阈值鉴定出176个差异表达基因，其中118个上调、58个下调，并列出Themis、Cfd、Aqp8、Osbpi3和Scd1等前5个上调基因。数据可用于脂肪肝分子特征分析及差异表达基因筛选研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 22 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：在本研究中，我们采用高果糖高胆固醇（HFHC饮食）喂养12周构建了单纯性脂肪肝（NAFL）小鼠模型。随后，我们进行RNA测序分析以揭示单纯性脂肪肝的分子特征。结果，我们获得了两组小鼠（NAFL组与正常组）肝脏的全基因组mRNA表达。以FDR 2为阈值，我们在NAFL小鼠肝脏中相对于正常对照小鼠鉴定出176个差异表达基因（DEGs），其中118个上调、58个下调。NAFL小鼠中前5个上调基因包括编码Themis、Cfd、Aqp8、Osbpi3和Scd1的基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL17021、10090。本站分类：消化系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE199121
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
在我们的研究中，我们通过高果糖和高胆固醇（HFHC饮食）喂养12周，构建了单纯性脂肪变性（NAFL）小鼠模型。接下来，我们进行了RNA测序分析，以揭示单纯性脂肪变性的分子特征。结果，我们获得了两组小鼠（NAFL组与正常组）肝脏的全基因组mRNA表达。以FDR < 0.01且倍数变化 > 2为阈值，我们在NAFL小鼠肝脏中相对于正常对照小鼠鉴定出176个差异表达基因（DEGs），其中118个上调，58个下调。NAFL小鼠中上调最显著的前5个基因包括编码Themis、Cfd、Aqp8、Osbpi3和Scd1的基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
