抗生素无应答艰难梭菌感染的粪菌移植(FMT)研究

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦抗生素治疗无应答的艰难梭菌感染(CDI)患者接受粪菌移植(FMT)的前瞻性、描述性队列研究

University of North Carolina, Chapel HillUniversity of North Carolina, Chapel Hill
clinicaltrials
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表格预测Clostridium Difficile
Fecal Microbiota Transplantation (FMT) in Clostridium Difficile Infection (CDI) Not Responding to Antibiotics

基本信息

模态
表格
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

抗生素无应答艰难梭菌感染的粪菌移植(FMT)研究

该数据集源自 clinicaltrials.gov,英文名称为 Fecal Microbiota Transplantation (FMT) in Clostridium Difficile Infection (CDI) Not Responding to Antibiotics,本站归类于消化系统疾病 / 其他。其聚焦对象为抗生素治疗无应答的艰难梭菌感染(CDI)患者,研究设计为前瞻性、描述性队列研究。研究情境中,患者接受当前标准治疗;当潜在受试者被计划进行粪菌移植(FMT)时,由研究协调员或研究者接触并邀请其参与研究。若患者同意参与,则从患者本人和/或医疗记录中采集健康、医疗及人口学信息,录入研究数据库,并与一个研究编码关联,粪便样本也使用该编码进行标记。研究协调员负责确保研究问卷的完成,问卷由 FMT 前和 FMT 后两部分组成,通常由医生或研究协调员在门诊访视时当面实施,但偶尔也可能由受试者在家完成后邮寄至研究协调方。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究关注艰难梭菌感染(CDI)在抗生素治疗无应答情况下的临床处理。艰难梭菌感染是消化系统疾病领域的重要问题,当常规抗生素治疗无法取得应答时,粪菌移植(FMT)成为一种被研究的干预路径。该研究以接受 FMT 的抗生素无应答 CDI 患者为对象,采用前瞻性、描述性队列研究设计,旨在围绕这一特定患者群体在真实临床流程中的情况进行系统观察与信息收集。研究并不改变患者所接受的当前标准治疗,而是在标准治疗基础上,对计划接受 FMT 的患者进行招募、信息采集与随访问卷管理。主题标签为 Clostridium Difficile,进一步明确了该数据集的核心疾病指向。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集涉及的信息包括:患者的健康信息、医疗信息与人口学信息,这些信息从患者本人和/或医疗记录中收集并录入研究数据库。数据库中的信息与一个研究编码相关联,粪便样本同样使用该研究编码进行标记,从而实现临床信息与生物样本之间的对应。此外,研究还包含一份研究问卷,问卷由 FMT 前部分和 FMT 后部分组成,用于在粪菌移植前后收集相应内容。源站描述未提供具体的变量字段、样本量、随访时间点、问卷条目细节或任何统计指标。

【采集与来源】

数据采集来自 clinicaltrials.gov 所登记的研究。采集流程为:当潜在受试者被计划进行 FMT 时,研究协调员或研究者主动接触患者,邀请其参与研究;患者同意参与后,由相关人员从患者和/或医疗记录中收集健康、医疗和人口学信息,并录入研究数据库,同时赋予研究编码,粪便样本也以该编码标记。研究协调员负责确保研究问卷的完成。问卷的实施方式以门诊访视时由医生或研究协调员当面进行为主,但偶尔也可由受试者在家完成并邮寄至研究协调方。源站未提供采集地点、采集时间跨度、样本运输与保存条件等更多细节。

【适用场景】

该数据集适用于与艰难梭菌感染(CDI)相关的临床研究场景,尤其是关注抗生素治疗无应答患者接受粪菌移植(FMT)的前瞻性、描述性队列研究。其信息结构可用于支持对 FMT 前后患者健康、医疗与人口学信息的描述性分析,也可用于将临床问卷信息与以研究编码标记的粪便样本进行关联。由于研究设计为描述性队列研究,且患者接受当前标准治疗,该数据集适合用于观察性、真实世界情境下的特征描述,而非用于推断干预效果。源站未提供其他具体适用场景。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据研究编码将患者健康、医疗和人口学信息与粪便样本进行对应。研究问卷分为 FMT 前与 FMT 后两部分,可分别用于移植前与移植后信息的组织与分析。源站描述未提供数据格式、访问方式、变量字典、统计软件要求或分析脚本等具体使用说明。

【质量与限制】

该研究为前瞻性、描述性队列研究,患者接受当前标准治疗,研究本身不涉及对标准治疗的改变。问卷通常当面实施,偶尔由受试者在家完成并邮寄,这一方式可能带来问卷完成方式上的差异。源站未提供样本量、缺失数据情况、随访完整性、偏倚控制措施或任何质量评价指标。因此,关于数据质量与局限性的更多判断,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款信息。

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使用方式

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源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03117582

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

病症:艰难梭菌感染。这是一项前瞻性、描述性队列研究。患者将接受当前的标准治疗。一旦潜在受试者计划接受粪菌移植(FMT),研究协调员或研究者将与其接触,邀请其参与研究。若患者同意参与研究,则将收集患者和/或病历中的健康、医疗及人口学信息,录入研究数据库,并与一个研究编码关联,粪便样本也将标注该编码。研究协调员将负责确保完成研究问卷,该问卷包括FMT前和FMT后两部分。问卷将尽量由医生或研究协调员在门诊访视时当面进行,但有时也可能由受试者在家完成后邮寄给研究协调员或医生,或通过电话与研究协调员或医生共同完成。粪便制剂将由非营利第三方机构OpenBiome提供,北卡罗来纳大学已与其合作一年有余。

制剂包括用于下消化道给药的250mL(毫升)制剂、用于上消化道给药的30mL制剂,以及用于口服给药的冷冻胶囊(一次治疗30粒)。在大多数情况下,实际的FMT操作将通过结肠镜进行。其他可能的给药途径包括鼻胃管或鼻十二指肠管(使用上消化道制剂)、灌肠和冷冻口服片剂。目前首选的给药途径是经结肠镜,这是基于观察性(非头对头)试验显示其疗效更佳,但护理标准未来可能会发生变化。在所有情况下,给药途径将基于患者特征和偏好,而非出于与研究相关的目的。在所有情况下,治疗的知情同意将按照美国食品药品监督管理局(FDA)的指导进行记录。患者将停止所有抗生素

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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