FFPE qPCR检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药性的可行性与性能

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07821294

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数据说明

条件：幽门螺杆菌感染。幽门螺杆菌（H. pylori）感染是一种常见的慢性细菌感染，与消化性溃疡病和胃部恶性肿瘤相关。克拉霉素耐药是治疗失败的重要原因。目前的建议支持基于克拉霉素耐药检测的敏感性指导治疗；然而，在常规临床实践中，耐药检测仍不常进行。这项前瞻性、单中心观察性研究将评估在常规胃镜检查期间采集的福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）胃活检组织上进行实时聚合酶链反应（qPCR）的可行性和诊断性能。该研究将探讨已获取用于组织病理学检查的FFPE组织样本是否可用于检测H. pylori及与克拉霉素耐药相关的23S rRNA基因突变。参与者为疑似H. pylori感染且需要在胃镜检查期间进行胃活检的成年人。H. pylori感染将通过组织学检查和免疫组织化学确认。对于确诊H.

对于幽门螺杆菌感染，将选取相应的FFPE组织块进行DNA提取，并针对与大环内酯类耐药相关突变进行qPCR检测。主要目标是在常规临床实践中，前瞻性评估FFPE胃活检组织qPCR检测幽门螺杆菌大环内酯类耐药的可行性和性能。诊断性能将包括幽门螺杆菌检测及大环内酯类耐药突变检测的敏感性和特异性，以及可获得可分析结果的样本比例和获得结果所需时间。次要目标包括描述研究人群中大环内酯类耐药突变的患病率和流行病学特征；评估FFPE qPCR与免疫组化之间的一致性，尤其是在细菌载量低的病例中

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。