野生黑猩猩的人口统计学、生活史权衡与胃肠道病毒组

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Adafbf693609c6325b8a26f9b8b9dcf06dc5ae87734d4379f4103320d13825a2d

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在人类中，衰老会增加对病毒感染的易感性。然而，关于自由生活非人灵长类动物——甚至包括我们现存最近的亲属黑猩猩和倭黑猩猩（Pan troglodytes和P. paniscus）——病毒感染比较数据相对稀缺，从而限制了对年龄相关病毒感染模式的进化理解。我们研究了野生东非黑猩猩（P. t. schweinfurthii）种群，利用宏基因组学对来自乌干达基巴莱国家公园Kanyawara和Ngogo群落的42只性成熟黑猩猩（22只雄性，20只雌性）粪便中的病毒组（完整病毒群落）进行了表征。我们鉴定出至少四个科的12种病毒，其基因组包含单链RNA和单链DNA。尽管雌雄两性的粪便病毒组均随黑猩猩年龄变化，但病毒丰富度在雄性中随年龄增加，而在雌性中则不然。这一效应主要由三种病毒所致：唾液病毒、porprismacovirus和黑猩猩粪便相关……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。