联合无监督与半自动监督流式细胞术分析揭示新诊断儿童1型糖尿病相关细胞指纹
该数据集基于流式细胞术,对107例新发1型糖尿病患儿、85例携带0-1种胰岛自身抗体的患者亲属、58例乳糜泻或自身免疫性甲状腺炎患者及76例健康对照的新鲜全血样本进行免疫表型分析

基本信息
资源简介
联合无监督与半自动监督流式细胞术分析揭示新诊断儿童1型糖尿病相关细胞指纹
Combined unsupervised and semi-automated supervised analysis of flow cytometry data reveals cellular fingerprint associated with newly diagnosed pediatric type 1 diabetes
该数据集基于流式细胞术,对107例新发1型糖尿病患儿、85例携带0-1种胰岛自身抗体的患者亲属、58例乳糜泻或自身免疫性甲状腺炎患者及76例健康对照的新鲜全血样本进行免疫表型分析。样本经红细胞裂解、洗涤后,用五组单克隆抗体panel(T细胞、T&NK细胞、B细胞、Tregs、DCs/单核细胞)染色,覆盖主要T细胞亚群。数据可用于探索1型糖尿病发病时的循环免疫组特征,支持无监督与半自动监督分析流程的复现与应用(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2022。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):1型糖尿病是一种慢性自身免疫性疾病,导致免疫介导的胰腺β细胞丢失;然而,在疾病发病时对1型糖尿病特异性循环免疫组进行无偏且可重复的分析尚未被探索。在本研究中,从107例新发1型糖尿病患儿、85例携带0-1种胰岛自身抗体的1型糖尿病患者亲属、58例乳糜泻或自身免疫性甲状腺炎患者以及76例健康对照的儿童队列中采集新鲜全血。每位受试者采集最多6 mL血液至VACUETTE® TUBE 6 ml ACD-B(Greiner)中。新鲜全血进行红细胞裂解、洗涤并用特异性单克隆抗体染色。新鲜全血样本用五组标记为T细胞、T&NK细胞、B细胞、Tregs和DCs/单核细胞的抗体panel染色,涵盖T细胞的主要亚群,
【主题与分类】
主题标签:type 1 diabetes、immunome。本站分类:消化系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/record/6624430
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.6624430
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 33.18 GB。
数据说明
1型糖尿病是一种慢性自身免疫性疾病,导致免疫介导的胰腺β细胞丢失;然而,在疾病发病时对1型糖尿病特异性循环免疫组进行无偏倚且可重复的分析尚未被探索。在本研究中,从107例新发1型糖尿病患者的儿科队列、85例带有0-1种胰岛自身抗体的1型糖尿病患者亲属、58例乳糜泻或自身免疫性甲状腺炎患者以及76例健康对照中采集新鲜全血。每位受试者采集最多6 mL血液至VACUETTE® TUBE 6 ml ACD-B(Greiner)中。新鲜全血经红细胞裂解、洗涤后用特异性单克隆抗体染色。新鲜全血样本用五组抗体 panel 染色,分别标记为T细胞、T&NK细胞、B细胞、Tregs和DCs/单核细胞,涵盖T细胞、NK细胞、B细胞、Tregs、DCs和单核细胞的主要亚群,使用26种表面标志物和细胞内标志物叉头框P3(FoxP3)进行检测;对于Treg panel,在固定和透化后进行细胞内染色。
细胞在配备FACSDiva软件的BD FACSCanto-II流式细胞仪(Becton Dickinson,Franklin Lakes,NJ)上采集。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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