强直性脊柱炎及其关节外表现共享非HLA遗传结构分析与GWAS汇总数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23551623

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 2.04 GB。

数据说明

随稿提供的分析代码和汇总数据：“强直性脊柱炎及其关节外表现共享的非HLA遗传结构定位于人体各器官的髓系和淋系免疫细胞”（Xu Q, Li S, Xiao C, Tian D, Chen H；已投稿）。内容：- code：按运行顺序排列的所有分析脚本（01-15；R和Python），附Windows启动器。- F_SpA_factorGWAS_.tsv.gz：强直性脊柱炎、前葡萄膜炎、炎症性肠病和银屑病的基因组结构方程模型（Genomic SEM）共同因子GWAS（GRCh37；已去除扩展MHC chr6:24-36 Mb；有效N = 84,294）。- AS/AU/IBD/PSO_meta_.tsv.gz：固定效应逆方差meta分析，合并FinnGen R13与Million Veteran Program、UK Biobank、Regeneron、IIBDGC或Pan-UK Biobank的汇总统计量（GRCh37）。- 补充表S1-S8、表2及结果表（MAGMA、细胞类型富集、scDRS、前节图谱、SMR/coloc、DGIdb）。- scDRS基因集及141,448个Tabula Sapiens 2.0免疫细胞的单细胞得分。- README.md（列定义）和MANIFEST.csv（文件大小和MD5校验和）。大文件按染色体拆分（必要时进一步拆分为_partNN），使每个文件≤ 20 MB。

请同时引用原始数据来源（FinnGen、MVP、UK Biobank、IIBDGC、Regeneron、Pan-UK Biobank、Tabula Sapiens、GEO GSE199013、eQTLGen、GTEx）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。