结肠无蒂锯齿状腺瘤/息肉与增生性息肉的平台独立基因表达特征数据集

该数据集包含结肠息肉亚型(如无蒂锯齿状腺瘤/息肉和增生性息肉)的基因表达数据,数据模态为基因表达水平表格,涵盖qRT-PCR实验获得的原始表达值、归一化结果以及差异表达基因列表,主要用于结肠息肉的分子分型研究、诊断标志物筛选以及基因表达特征在临床鉴别中的应用。

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2017-12-29 更新
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结肠息肉分子分型基因表达诊断

基本信息

创建/更新时间
2017-12-29

资源简介

该数据集是一个基因表达数据集,旨在通过多平台独立的分子特征区分结肠息肉中的无蒂锯齿状腺瘤/息肉(SSA/Ps)和增生性息肉(HP)。数据包含qRT-PCR实验获得的原始和归一化表达水平,以及多个差异表达基因列表,如表S1中的qRT-PCR引物信息、表S2-S3中的45个独立FFPE样本的基因表达数据与分类结果、表S4-S7中的SSA/Ps与HP及正常结肠样本间的差异表达基因比较、表S8中的跨平台基因重叠分析,以及表S9-S11中基于不同基因签名(如18基因、16基因和13基因签名)的分类概率计算。数据来源于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本,通过实验测量和生物信息学分析构建,主要用于结肠息肉的分子分型、诊断标志物发现以及基因表达特征在临床病理鉴别中的应用研究。

原始链接

https://springernature.figshare.com/articles/Additional_file_1_of_Platform-independent_gene_expression_signature_differentiates_sessile_serrated_adenomas_polyps_and_hyperplastic_polyps_of_the_colon/5742336/1

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数据说明

该数据集是一个基因表达数据集,旨在通过多平台独立的分子特征区分结肠息肉中的无蒂锯齿状腺瘤/息肉(SSA/Ps)和增生性息肉(HP)。数据包含qRT-PCR实验获得的原始和归一化表达水平,以及多个差异表达基因列表,如表S1中的qRT-PCR引物信息、表S2-S3中的45个独立FFPE样本的基因表达数据与分类结果、表S4-S7中的SSA/Ps与HP及正常结肠样本间的差异表达基因比较、表S8中的跨平台基因重叠分析,以及表S9-S11中基于不同基因签名(如18基因、16基因和13基因签名)的分类概率计算。数据来源于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本,通过实验测量和生物信息学分析构建,主要用于结肠息肉的分子分型、诊断标志物发现以及基因表达特征在临床病理鉴别中的应用研究。

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