EGA_PBC_phased 日本原发性胆汁性胆管炎全基因组关联研究队列
EGA_PBC_phased 来源于 omicsdi.org,属于消化系统疾病中的肝硬化相关数据集,主题标签为 Genomics

基本信息
资源简介
EGA_PBC_phased 日本原发性胆汁性胆管炎全基因组关联研究队列
EGA_PBC_phased 是一个以基因组学为核心主题的数据集,收录于 omicsdi.org,并在本站归类于消化系统疾病下的肝硬化方向。该数据集围绕日本原发性胆汁性胆管炎全基因组关联研究(Japan PBC-GWAS Study)所建立的研究队列展开,源站描述指出该队列由 2886 名参与者组成。原发性胆汁性胆管炎是一种与消化系统密切相关的慢性疾病,可进展为肝硬化,因此该数据集在疾病分类上与肝硬化这一方向相对应。数据集名称中的 phased 提示其内容可能与基因型分型或单倍型定相处理有关,但具体处理方式源站未提供。整体而言,该数据集为研究肝硬化相关遗传背景提供了一个以人群队列为基础的基因组学资源。
【数据集背景】
该数据集来源于 omicsdi.org,属于消化系统疾病中肝硬化相关分类,主题标签为 Genomics。其对应的研究背景是日本 PBC-GWAS 研究,即针对原发性胆汁性胆管炎开展的全基因组关联研究。原发性胆汁性胆管炎是一种慢性胆汁淤积性肝病,长期发展可能涉及肝硬化等终末期肝病表现,因此该队列被归入肝硬化相关数据集具有疾病分类上的依据。关于该研究的具体立项背景、研究机构、资助来源以及研究目的等更详细信息,源站未提供。
【数据内容】
源站描述仅说明这是一个由 2886 名参与者组成的队列,属于日本 PBC-GWAS 研究。数据集英文名为 EGA_PBC_phased,主题标签为 Genomics,表明其内容属于基因组学范畴。名称中的 phased 可能指向定相后的基因型数据,但数据的具体类型、文件格式、变异位点数量、样本层面的遗传信息、是否包含临床表型或随访信息等内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 omicsdi.org,源站描述指出其队列为日本 PBC-GWAS 研究的 2886 名参与者。关于参与者的招募方式、纳入与排除标准、样本采集地点、采集时间、样本类型、测序或基因分型平台、数据产生流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集可被用于与肝硬化相关的基因组学研究,尤其是围绕原发性胆汁性胆管炎遗传背景的分析。其主题标签为 Genomics,且属于消化系统疾病下的肝硬化分类,因此适用于遗传关联研究、队列遗传分析等方向。关于该数据集是否适用于特定分析流程、是否可用于跨人群比较、是否支持临床转化研究等具体应用场景,源站未提供。
【使用方法】
关于该数据集的获取方式、访问权限、下载流程、数据处理步骤、分析工具要求以及是否需要特定的伦理审批或数据使用协议等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 2886 名参与者组成,来源于日本 PBC-GWAS 研究。关于数据质量评估指标、缺失率、批次效应、人群分层情况、样本重复或排除情况、数据版本与更新记录等质量相关信息,源站未提供。其限制方面,现有信息仅能表明该数据集与日本人群的原发性胆汁性胆管炎研究相关,是否可外推至其他人群或其他肝硬化病因,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及是否需要联系原始研究方获取授权等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001533
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
A cohort of 2886 participants of the Japan PBC-GWAS Study
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