肝硬化数据
该数据集包含130个来自肝硬化患者和健康个体的粪便样本，涉及基因测序数据（如Illumina HiSeq测序结果）和微生物分类学信息（如相对丰度），主要用于研究肝硬化与肠道微生物组之间的关联，支持疾病诊断预测、微生物组分析和生物信息学领域的应用。
基本信息
资源简介
肝硬化数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cirrhosis data》。源站首次发布：2022-06-27。
【数据内容】
源站原始描述：Data were originally published by Qin et al., 2014 (DOI: 10.1038/nature13568) and were downloaded from the ML repo ( accessed on 27/01/2021). The data set consists of 130 stool samples from cirrhotic and healthy individuals, from which Qin et al. extracted gDNA and sequenced it via an Illumina HiSeq sequencer. They profiled metagenomes with BURST and Prokaryotic RefSeq Genomes. The downloaded taxonomic profiles consisted of read counts for taxonomic levels not collapsed at coarser level (i.e., i…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 330.07 KB。Cirrhosis_X.RDS：application/gzip，329.95 KB。Cirrhosis_y.RDS：application/gzip，117 B。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.20145209.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Microbiology not elsewhere classified、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。主题标签：Human Gut Microbiome Data、metagenomic datasets、Microbiology、Bioinformatics。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Microbiology not elsewhere classified、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Cirrhosis_data/20145209
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Ruaud (2022). Cirrhosis data. figshare. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-10，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/Cirrhosis_data/20145209
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个关于肝硬化与健康个体肠道微生物组的研究数据集，最初由Qin等人于2014年发表（DOI:10.1038/nature13568），数据来源于MLRepo。该数据集包含130个粪便样本，其中涵盖肝硬化患者和健康个体的样本。通过提取gDNA并使用Illumina HiSeq测序仪进行测序，研究人员利用BURST和Prokaryotic RefSeq Genomes对宏基因组进行了分析，并提供了分类学水平的读数计数。数据经过处理后，通过汇总各分类水平下的读数计数并归一化得到相对丰度，同时使用渐进阈值对分类群进行过滤。该数据集主要用于研究肝硬化与肠道微生物组之间的关系，支持疾病诊断预测、微生物组分析和生物信息学研究。
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