肝硬化数据

该数据集包含130个来自肝硬化患者和健康个体的粪便样本,涉及基因测序数据(如Illumina HiSeq测序结果)和微生物分类学信息(如相对丰度),主要用于研究肝硬化与肠道微生物组之间的关联,支持疾病诊断预测、微生物组分析和生物信息学领域的应用。

RuaudRuaud
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2022-06-27 更新
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肠道微生物组学肝硬化诊断预测

基本信息

创建/更新时间
2022-06-27

资源简介

该数据集是一个关于肝硬化与健康个体肠道微生物组的研究数据集,最初由Qin等人于2014年发表(DOI:10.1038/nature13568),数据来源于MLRepo。该数据集包含130个粪便样本,其中涵盖肝硬化患者和健康个体的样本。通过提取gDNA并使用Illumina HiSeq测序仪进行测序,研究人员利用BURST和Prokaryotic RefSeq Genomes对宏基因组进行了分析,并提供了分类学水平的读数计数。数据经过处理后,通过汇总各分类水平下的读数计数并归一化得到相对丰度,同时使用渐进阈值对分类群进行过滤。该数据集主要用于研究肝硬化与肠道微生物组之间的关系,支持疾病诊断预测、微生物组分析和生物信息学研究。

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https://figshare.com/articles/dataset/Cirrhosis_data/20145209

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源站:https://figshare.com/articles/dataset/Cirrhosis_data/20145209

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数据说明

该数据集是一个关于肝硬化与健康个体肠道微生物组的研究数据集,最初由Qin等人于2014年发表(DOI:10.1038/nature13568),数据来源于MLRepo。该数据集包含130个粪便样本,其中涵盖肝硬化患者和健康个体的样本。通过提取gDNA并使用Illumina HiSeq测序仪进行测序,研究人员利用BURST和Prokaryotic RefSeq Genomes对宏基因组进行了分析,并提供了分类学水平的读数计数。数据经过处理后,通过汇总各分类水平下的读数计数并归一化得到相对丰度,同时使用渐进阈值对分类群进行过滤。该数据集主要用于研究肝硬化与肠道微生物组之间的关系,支持疾病诊断预测、微生物组分析和生物信息学研究。

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