乳糜泻病例对照北印度 Immunochip 数据集
该数据集为北印度来源的乳糜泻病例与对照样本的 Illumina Immunochip 基因型数据，数据以 PLINK 二进制格式存储
基本信息
资源简介
乳糜泻病例对照北印度 Immunochip 数据集
Celiac disease case-control North Indian Immunochip dataset 是一个面向乳糜泻遗传学研究的基因型数据集，收录于 omicsdi.org，在本站归类于消化系统疾病下的乳糜泻方向。该数据集的核心内容为北印度来源的乳糜泻病例与对照样本的 Illumina Immunochip 基因型数据，数据以 PLINK 二进制格式存储，主题标签为 Genomics。整体来看，它属于病例-对照设计下的高通量基因分型资源，可用于围绕乳糜泻易感性开展群体遗传学与关联分析等研究，尤其适合关注南亚人群、特别是北印度人群遗传背景的研究者使用。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
乳糜泻是一种与遗传易感性密切相关的消化系统疾病，其发病机制涉及免疫相关基因区域的多态性。针对不同人群开展病例-对照基因分型研究，有助于理解疾病在不同遗传背景下的易感因素分布。该数据集正是面向北印度来源样本构建的乳糜泻病例-对照 Immunochip 基因型资源，服务于相关遗传关联研究的需求。本站将其归入消化系统疾病 / 乳糜泻分类，主题标签为 Genomics，表明其定位属于基因组学层面的疾病研究数据。
【数据内容】
该数据集包含北印度来源的乳糜泻病例与对照样本的 Illumina Immunochip 基因型数据。数据以 PLINK 二进制格式存储，这一格式通常用于存储个体水平的基因型信息，便于后续遗传学分析工具直接读取与处理。样本分为病例组与对照组，构成病例-对照研究设计。关于样本量的具体数字、纳入的变异位点数量、性别与年龄构成等信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。样本来源为北印度。基因分型平台为 Illumina Immunochip。基因型判定算法基于 GenomeStudio（GenTrain），并对选定的变异进行了人工聚类（manual clustering）。关于样本采集时间、采集机构、伦理审批信息以及具体的招募流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于乳糜泻相关的遗传关联研究，尤其是针对北印度人群的病例-对照分析。由于采用 Immunochip 平台，其内容通常聚焦于免疫相关区域，因此可用于考察免疫相关基因区域与乳糜泻之间的关联。此外，也可用于群体遗传学比较、基因型质量控制流程的验证，以及作为南亚人群乳糜泻遗传研究的参考数据。关于该数据集是否已被用于特定发表研究或是否支持全基因组层面的分析，源站未提供。
【使用方法】
使用者可借助支持 PLINK 二进制格式的遗传学分析工具读取该数据集，开展关联分析、质量控制、群体分层评估等常规流程。由于基因型判定基于 GenomeStudio（GenTrain）并包含对选定变异的人工聚类，使用者在分析前宜关注分型质量与聚类情况对结果的影响。关于具体的下载方式、访问链接、文件命名规则以及是否提供配套的表型文件，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的一个显著特征是基因型判定采用 GenomeStudio（GenTrain）算法，并对选定变异进行了人工聚类，这在一定程度上体现了分型过程中的质量控制措施。其限制在于样本来源限定为北印度人群，结论外推至其他人群时需谨慎；同时，数据为 PLINK 二进制格式，需要相应的生物信息学工具支持。关于缺失率、杂合度、重复样本一致性等具体质量指标，以及样本量是否足以支撑特定统计功效，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制以及是否需要向数据提供方申请授权等信息，源站未提供。使用者在利用该数据集开展研究或发表成果前，应自行向来源站 omicsdi.org 及相关数据提供方核实引用规范与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001000849
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Illumina Immunochip基因型数据，来源于北印度样本的乳糜泻患者和对照样本。数据为PLINK二进制格式。基因型判定算法基于GenomeStudio（GenTrain），并对选定的变异进行手动聚类。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
