乳糜泻患者单细胞T细胞受体配对序列数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了从单细胞中测序获得的配对 T 细胞受体序列,细胞类型为上皮内 CD8+ αβ T 细胞

omicsdi
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基因组分类Genomics
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基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

乳糜泻患者单细胞T细胞受体配对序列数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了从单细胞中测序获得的配对 T 细胞受体序列,细胞类型为上皮内 CD8+ αβ T 细胞。这些序列来自未经治疗和经过治疗(采用无麸质饮食)的乳糜泻患者以及对照个体。数据集在站内被归类于消化系统疾病下的乳糜泻方向,主题标签为 Genomics。整体而言,该数据集围绕乳糜泻这一自身免疫性肠道疾病,提供了在单细胞层面获取的适应性免疫受体信息,可用于观察上皮内 CD8+ αβ T 细胞受体配对的序列特征,并支持在治疗状态与对照之间进行比较分析。

【数据集背景】

乳糜泻是一种与摄入麸质相关的消化系统疾病,其免疫机制涉及肠道上皮内 T 细胞的参与。该数据集聚焦于上皮内 CD8+ αβ T 细胞,这类细胞在肠道免疫监视和麸质相关免疫反应中具有重要作用。通过单细胞测序获得配对的 T 细胞受体序列,有助于在单个细胞水平上解析 T 细胞受体的 α 链与 β 链组合信息。数据集同时涵盖未经治疗的乳糜泻患者、接受无麸质饮食治疗的乳糜泻患者以及对照个体,为理解治疗干预前后以及疾病与对照状态下的 T 细胞受体特征提供了样本基础。源站描述未提供更多关于疾病机制、研究假设或具体临床背景的说明。

【数据内容】

数据集的核心内容是配对 T 细胞受体序列,这些序列从单细胞中测序获得。所谓配对,意味着同一细胞内的 T 细胞受体 α 链和 β 链序列被同时捕获并关联,从而保留单个 T 细胞的受体组合信息。细胞类型明确为上皮内 CD8+ αβ T 细胞。样本来源涵盖三类个体:未经治疗的乳糜泻患者、经过治疗(采用无麸质饮食)的乳糜泻患者以及对照个体。主题标签为 Genomics,表明数据属于基因组学范畴。除上述内容外,源站未提供关于序列数量、读长、链类型比例、克隆型多样性或具体基因片段使用情况的进一步信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出,序列是从单细胞中测序获得的配对 T 细胞受体序列,细胞类型为上皮内 CD8+ αβ T 细胞,样本来自未经治疗和经过治疗(采用无麸质饮食)的乳糜泻患者以及对照个体。关于具体的样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序平台、建库方法或数据处理流程,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于涉及乳糜泻的免疫受体研究场景,例如比较未经治疗与无麸质饮食治疗状态下上皮内 CD8+ αβ T 细胞的配对 T 细胞受体序列特征,或与对照个体进行对比。由于数据以单细胞配对受体序列形式呈现,也适用于关注单个 T 细胞受体 α 链与 β 链组合的分析。主题标签 Genomics 提示其可归入基因组学相关分析流程。除上述方向外,源站未提供关于具体适用分析类型、疾病分型或临床终点应用的说明。

【使用方法】

源站未提供关于数据下载方式、文件格式、数据组织结构和分析工具的具体说明。使用者需依据 omicsdi.org 上该数据集的原始页面获取进一步的操作信息。源站未提供使用步骤、预处理要求或推荐分析流程。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、测序深度、细胞数量、样本量、批次效应或验证结果的信息。由于样本涵盖未经治疗和经过治疗的乳糜泻患者以及对照个体,分析时需注意治疗状态和个体差异可能带来的影响,但源站未提供具体的质量控制指标或局限性说明。使用者应结合原始来源页面的信息自行判断数据适用性。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款。使用者应访问 omicsdi.org 上对应的数据集页面,以获取引用要求和许可信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006900

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从单细胞测序获得的配对T细胞受体序列,来源于上皮内CD8+ αβ T细胞。这些序列来自未经治疗和经过治疗(采用无麸质饮食)的乳糜泻患者及对照组。

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