人类ABCB11基因在大肠杆菌中的克隆及CRISPR-Cas9介导的AAVS1安全港位点插入测序数据
该数据集为F1000 Research论文的补充测序数据,围绕人ABCB11基因在大肠杆菌中克隆时需去除基因内Pribnow-Schaller盒、再经CRISPR Cas9插入基因组安全港AAVS1位点的研究

基本信息
资源简介
人类ABCB11基因在大肠杆菌中的克隆及CRISPR-Cas9介导的AAVS1安全港位点插入测序数据
该数据集为一项基因工程研究的补充测序数据,英文名称为“Sequencing Data, supplementary data to Cloning of Human ABCB11 Gene in E. coli required the removal of an Intragenic Pribnow-Schaller Box before it’s Insertion into Genomic Safe Harbor AAVS1 Site using CRISPR Cas9”。其核心研究内容围绕人ABCB11基因展开:在大肠杆菌中进行克隆时,需要先去除基因内部的Pribnow-Schaller盒,随后利用CRISPR Cas9系统将该基因插入基因组安全港AAVS1位点。数据集来源于search.dataone.org,对应F1000 Research期刊论文的补充材料,主题涉及引物、PCR、ABCB11、脱靶分析及相关表格,归属于消化系统疾病/胆道闭锁分类,面向医学、健康与生命科学领域。
【数据集背景】
该数据集是一项基因克隆与基因编辑研究的补充测序数据。研究关注人ABCB11基因,该基因的克隆工作在大肠杆菌中完成。研究过程中发现,将人ABCB11基因导入大肠杆菌时,基因内部存在的Pribnow-Schaller盒会带来问题,因此需要在克隆前将其去除。随后,研究采用CRISPR Cas9技术,将处理后的基因插入基因组安全港AAVS1位点。数据集即为支撑上述研究流程的测序数据与相关补充材料,随F1000 Research论文一同发布。
【数据内容】
数据集内容属于测序数据及论文补充数据,主题标签涵盖引物(Primers)、PCR、ABCB11、脱靶(off-targets)以及表格(tables)。从标签可以看出,数据涉及引物设计与PCR相关实验信息、ABCB11基因相关测序结果、CRISPR Cas9编辑的脱靶分析,以及以表格形式组织的补充材料。数据所属分类为消化系统疾病下的胆道闭锁方向,学科领域为医学、健康与生命科学。除上述标签与主题信息外,源站未提供更细化的数据文件清单或字段说明。
【采集与来源】
数据集的来源站为search.dataone.org。源站描述表明,该数据为F1000 Research论文“Sequencing Data, supplementary data to Cloning of Human ABCB11 Gene in E. coli required the removal of an Intragenic Pribnow-Schaller Box before it’s Insertion into Genomic Safe Harbor AAVS1 Site using CRISPR Cas9”的补充测序数据。关于具体的样本来源、测序平台、实验地点与时间等采集细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与ABCB11基因克隆、大肠杆菌表达、CRISPR Cas9介导的基因组安全港AAVS1位点插入以及脱靶分析相关的研究场景。由于包含引物与PCR相关信息,可用于参考或复核相关实验的引物设计与扩增方案;由于涉及脱靶标签,也可用于CRISPR编辑特异性评估方面的参考。其所属的胆道闭锁与消化系统疾病分类,提示其可能服务于该疾病方向的基础研究。具体适用场景的边界,源站未提供进一步说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法、文件组织方式或分析流程说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、数据完整性或使用限制的说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式与许可信息。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
F1000 Research稿件:测序数据,补充数据——在大肠杆菌中克隆人ABCB11基因需在利用CRISPR Cas9将其插入基因组安全港AAVS1位点之前移除基因内Pribnow-Schaller盒
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