基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-17

资源简介

WTCCC 原发性胆汁性肝硬化队列样本数据集

EGAD00000000056 是一个以基因组学为核心主题的数据集，来源于 omicsdi.org，收录了 WTCCC 项目中原发性胆汁性肝硬化队列的样本。原发性胆汁性肝硬化是一种与自身免疫相关的慢性胆汁淤积性肝病，本站将其归类于消化系统疾病下的自身免疫性胆管炎。该数据集的主题标签为 Genomics，表明其内容围绕基因组层面的检测与信息展开，适用于从遗传变异角度研究该疾病的科研场景。整体而言，该数据集为关注自身免疫性胆管炎及消化系统疾病遗传基础的研究者提供了一个可检索、可获取的数据资源入口，其核心价值在于将 WTCCC 项目的原发性胆汁性肝硬化队列样本与基因组学主题相关联，便于后续在遗传关联、疾病易感性等方向开展分析。

【数据集背景】

该数据集来源于 omicsdi.org，其源站描述为 WTCCC project samples from the primary biliary cirrhosis cohort。WTCCC 项目在此作为样本来源被提及，说明该数据集与这一项目下的原发性胆汁性肝硬化队列直接相关。原发性胆汁性肝硬化属于自身免疫性胆管炎范畴，本站将其归入消化系统疾病分类。数据集以 EGAD00000000056 作为英文标识名，主题标签为 Genomics，表明其定位在基因组学领域。关于 WTCCC 项目的具体组织背景、启动时间、研究目标等更详细的信息，源站未提供。

【数据内容】

该数据集收录的是 WTCCC 项目原发性胆汁性肝硬化队列的样本。从主题标签 Genomics 可知，其内容与基因组学相关。本站分类将其归入消化系统疾病下的自身免疫性胆管炎，说明该数据集在疾病维度上对应自身免疫性胆管炎这一方向。关于样本的具体数量、样本类型、检测平台、数据文件格式、基因组变异类型、覆盖范围等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org，源站描述明确指出其样本来自 WTCCC 项目的原发性胆汁性肝硬化队列。因此，采集与来源的核心信息是：样本归属于 WTCCC 项目下的原发性胆汁性肝硬化队列，并通过 omicsdi.org 进行收录与展示。关于采集时间、采集地点、伦理审批、知情同意、样本处理流程等具体信息，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签 Genomics 以及本站分类消化系统疾病 / 自身免疫性胆管炎，该数据集适用于与基因组学相关的自身免疫性胆管炎研究场景，尤其是围绕原发性胆汁性肝硬化队列的遗传分析。潜在用途包括在基因组层面探索该疾病的遗传特征、开展关联分析或作为相关研究的样本资源。由于源站描述仅提及 WTCCC 项目样本，未给出具体分析类型或研究结论，因此更细化的适用场景需结合使用者自身的研究设计。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否支持特定分析流程，源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 omicsdi.org 提供来源信息，用户可依据来源站进行访问与检索。关于下载方式、数据格式、是否需要申请权限、是否有配套工具或 API、是否提供元数据文件等具体使用说明，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的主题标签为 Genomics，来源站为 omicsdi.org，源站描述为 WTCCC 项目原发性胆汁性肝硬化队列样本。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本排除标准、数据完整性等质量相关信息，源站未提供。关于使用限制、访问限制或伦理约束等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的英文标识名为 EGAD00000000056，来源站为 omicsdi.org。关于引用格式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00000000056

访问原始数据

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00000000056

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

WTCCC project samples from the primary biliary cirrhosis cohort

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别