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创建/更新时间

2026-10-08

资源简介

特发性贲门失弛缓症患者的miRNAs表达谱

该数据集名为 miRNAs expression profiling in patients with Idiopathic Achalasia，聚焦于消化系统疾病中的贲门失弛缓症这一特定病种，旨在研究贲门失弛缓症患者体内 miRNA 与 mRNA 表达水平之间的关系。数据集归属于转录组表达谱分析范畴，采用芯片技术进行转录 profiling，研究对象为人（Homo sapiens）。从整体定位来看，该数据集为探索贲门失弛缓症的分子表达特征与潜在调控机制提供了表达谱层面的数据基础，可用于比较患者样本中 miRNA 与 mRNA 的表达情况，进而帮助研究者理解二者在疾病状态下的关联模式。其来源站为 ebi.ac.uk，主题标签涵盖 transcription profiling by array 与 Homo sapiens，分类上归入消化系统疾病 / 贲门失弛缓症方向。

【数据集背景】

贲门失弛缓症属于消化系统疾病，其分子层面的表达变化是理解疾病机制的重要切入点。该数据集的核心研究目标，是考察贲门失弛缓症患者中 miRNA 与 mRNA 表达水平之间的关系。通过转录 profiling by array 的方式，数据集将研究视角落在 miRNA 与 mRNA 两类表达信息上，试图从表达谱的关联中揭示该疾病状态下可能存在的分子表达特征与调控线索。数据集以 Homo sapiens 为研究对象，主题标签明确指向转录组表达谱分析，说明其数据性质属于芯片表达谱类型，而非其他类型的组学数据。

【数据内容】

该数据集的内容围绕贲门失弛缓症患者的 miRNA 表达谱展开，同时涉及 mRNA 表达水平，以便研究二者之间的关系。数据主题标签为 transcription profiling by array，表明数据以芯片转录表达谱的形式组织。数据集覆盖消化系统疾病中的贲门失弛缓症，可用于研究患者体内 miRNA 与 mRNA 表达水平之间的关系，帮助探索该疾病的分子表达特征与潜在调控机制。关于样本数量、具体 miRNA 或 mRNA 的条目数、表达值范围、分组设计等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。其源站描述为：To study the relationship among levels of expression of miRNA-mRNA in achalasia patients. 由此可知，数据采集与研究的目的在于分析贲门失弛缓症患者中 miRNA-mRNA 表达水平之间的关系。数据集英文名称为 miRNAs expression profiling in patients with Idiopathic Achalasia，研究对象为人。关于具体的采集地点、采集时间、样本处理流程、实验平台型号、数据生成机构等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于消化系统疾病尤其是贲门失弛缓症相关的分子表达研究。具体而言，可用于研究患者体内 miRNA 与 mRNA 表达水平之间的关系，帮助探索该疾病的分子表达特征与潜在调控机制。由于数据主题标签包含 transcription profiling by array 与 Homo sapiens，其适用场景也涵盖基于人类芯片转录表达谱的分析工作，例如围绕 miRNA-mRNA 表达关联开展的探索性研究。关于是否适用于临床诊断、预后判断或药物靶点筛选等具体应用，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可用于围绕贲门失弛缓症患者 miRNA 与 mRNA 表达水平关系开展分析。使用时可结合转录 profiling by array 的数据特点，对 miRNA 与 mRNA 的表达信息进行关联性考察，以探索该疾病的分子表达特征与潜在调控机制。关于具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析工具与参数设置等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集聚焦于贲门失弛缓症患者的 miRNA 表达谱及 miRNA-mRNA 表达关系，研究对象为人，数据主题为 transcription profiling by array。其潜在限制在于，源站未提供样本量、平台信息、数据完整性、批次效应、归一化方法及验证实验等关键质量信息，因此无法对数据质量作出进一步判断。关于数据是否存在缺失、偏差或其他质量控制问题，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用方式、文献出处、许可协议、使用条款及数据再分发规定等，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-7333

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使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-7333

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-MTAB-7333 特发性贲门失弛缓症患者的miRNA表达谱分析通过芯片进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 人类研究贲门失弛缓症患者中miRNA-mRNA表达水平之间的关系。P-MTAB-79542 芯片扫描和特征提取方案 EFO

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别