phs000425:欧洲与非洲裔美国人酒精依赖 GWAS
该数据集为 dbGaP 收录的 phs000425 研究,主题是欧洲裔与非洲裔美国人群中的酒精依赖全基因组关联分析(GWAS)

基本信息
资源简介
phs000425:欧洲与非洲裔美国人酒精依赖 GWAS
phs000425 是一项收录于 dbGaP 的研究数据集,英文全称为 Alcohol Dependence GWAS in European- and African Americans,即欧洲裔与非洲裔美国人群中的酒精依赖全基因组关联分析。该研究采用病例对照与患病同胞对的设计,聚焦于酒精依赖这一化学诱发性障碍相关主题。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究项目,主题标签包括 Case-Control 与 Affected Sib Pairs。整体而言,该数据集为在两类美国人群中开展酒精依赖遗传关联研究提供了基础资源,其核心定位是围绕酒精依赖开展全基因组关联分析,并同时纳入病例对照与家系受累同胞对两种样本组织方式。
【数据集背景】
该数据集对应 dbGaP 研究编号 phs000425,研究主题为酒精依赖的全基因组关联分析。研究对象覆盖欧洲裔与非洲裔美国人群,这一人群构成使其区别于仅针对单一祖源群体的关联研究。酒精依赖属于化学诱发性障碍范畴,本站将其归类于化学诱发性障碍下的其他类别。研究设计同时包含病例对照与患病同胞对两种类型,说明其既关注群体层面的病例与对照比较,也关注家系内受累同胞对的遗传共享特征。源站将其描述为 dbGaP study,设计类型标注为 Case-Control, Affected Sib Pairs。
【数据内容】
该数据集的核心内容是酒精依赖的全基因组关联分析数据,涉及欧洲裔与非洲裔美国人群。研究采用病例对照与患病同胞对设计,因此数据内容在样本层面同时涵盖病例与对照个体,以及受累同胞对。主题标签明确为 Case-Control 与 Affected Sib Pairs。关于具体的标记数量、样本量、表型字段、基因分型平台、变异位点数目等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究。源站描述其为 dbGaP study,设计类型为 Case-Control, Affected Sib Pairs。研究全称为 Alcohol Dependence GWAS in European- and African Americans。关于样本采集地点、招募方式、采集时间、伦理审批信息、资助来源等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕酒精依赖开展的全基因组关联分析研究,尤其适用于在欧洲裔与非洲裔美国人群中比较病例与对照的遗传关联,以及利用患病同胞对设计进行家系内关联或连锁分析。其病例对照与患病同胞对的双重设计,可用于探讨酒精依赖的遗传易感性。由于主题标签为 Case-Control 与 Affected Sib Pairs,该数据也可用于方法学上对两种设计进行比较或整合的分析场景。关于具体的分析软件、统计模型或下游应用示例,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 dbGaP 平台发布,研究编号为 phs000425。使用者通常需通过 dbGaP 的受控访问流程申请获取数据。关于具体的申请步骤、访问层级、数据下载格式、配套文档、分析脚本等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的设计类型为病例对照与患病同胞对,研究对象为欧洲裔与非洲裔美国人群。关于样本质量、基因分型质控指标、缺失率、群体分层校正情况、统计效力、重复性或验证结果等,源站未提供。使用时应关注其人群构成与设计类型对结论外推的限制,但具体限制内容源站未提供。
【引用与许可】
该数据集为 dbGaP 收录的研究,编号 phs000425,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、许可条款、数据使用协议、致谢要求等,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000425
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Control, Affected Sib Pairs).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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