U2OS细胞CCCP诱导线粒体损伤及洗脱恢复的时间序列RNA-seq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342354

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

线粒体持续暴露于损伤之中，这种损伤会导致衰老和疾病。虽然长期线粒体损伤会触发线粒体自噬，但细胞如何应对短暂损伤仍不清楚。为了研究短暂线粒体损伤及随后恢复背后的转录程序，我们对经线粒体解偶联剂CCCP处理的人U2OS细胞进行了时间序列RNA-seq分析。共分析四组：未处理对照（WT）、50 μM CCCP处理30分钟（CCCP）、50 μM CCCP处理30分钟后洗脱1小时（W1H）、50 μM CCCP处理30分钟后洗脱6小时（W6H）。每种条件均进行三次重复分析。该数据集揭示了线粒体损伤与恢复过程中的动态转录景观，突出显示了促进线粒体修复的应激反应性转录因子和抗氧化防御通路的激活。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。