斑马鱼石房蛤毒素转录组响应实验室实验的遗传登录号、处理信息与方法

该数据集来自 search.dataone.org,收录实验室中研究斑马鱼(Danio rerio)对石房蛤毒素转录组响应的遗传登录号、处理信息与方法

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基因组oceans
Genetic accessions, treatment information, and methodology from laboratory experiments studying transcriptomic responses to saxitoxin in zebrafish (Danio rerio)

基本信息

模态
基因组
许可
https://spdx.org/licenses/CC-BY-4.0, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

斑马鱼石房蛤毒素转录组响应实验室实验的遗传登录号、处理信息与方法

Genetic accessions, treatment information, and methodology from laboratory experiments studying transcriptomic responses to saxitoxin in zebrafish (Danio rerio)

该数据集来自 search.dataone.org,收录实验室中研究斑马鱼(Danio rerio)对石房蛤毒素转录组响应的遗传登录号、处理信息与方法。相关数据已存入 NCBI 的 Gene Expression Omnibus(GEO),可通过 GEO Series 登录号 GSE204989 访问;Sequence Read Archive(SRA)数据、BioSamples 及 GEO 记录可通过 NCBI BioProject PRJNA843039 获取。该数据可用于分析斑马鱼在石房蛤毒素暴露下的基因表达变化及相关实验方法参考(来源 DataONE,https://spdx.org/licenses/CC-BY-4.0, 。

【主题与分类】

主题标签:oceans。本站分类:化学诱发性障碍/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A122e5b26e06b4a72a750f0d4ee3c07056d7a145e5553fdb2417000e86ab77131

使用许可:https://spdx.org/licenses/CC-BY-4.0, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本出版物中讨论的数据已存入 NCBI 的 Gene Expression Omnibus (GEO),可通过 GEO Series 登录号 GSE204989 访问(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE204989)。Sequence Read Archive (SRA) 数据、BioSamples 和 GEO 存储内容可从 NCBI BioProject PRJNA843039 访问(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA843039)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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