评估mRNA和microRNA谱揭示原代小鼠肝细胞在遗传毒性或非遗传毒性致癌物暴露后的判别性和化合物特异性反应

该数据集来源于omicsdi.org,主题标签为Transcriptomics,属于化学诱发性障碍/其他分类。源站描述指出这是一个SuperSeries,由下方列出的SubSeries组成,需参考各个Series

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时间序列分类Transcriptomics
Evaluating mRNA and microRNA profiles reveals discriminative and compound-specific responses following genotoxic or non-genotoxic carcinogen exposure in primary mouse hepatocytes

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-13

资源简介

评估mRNA和microRNA谱揭示原代小鼠肝细胞在遗传毒性或非遗传毒性致癌物暴露后的判别性和化合物特异性反应

该数据集英文名为 Evaluating mRNA and microRNA profiles reveals discriminative and compound-specific responses following genotoxic or non-genotoxic carcinogen exposure in primary mouse hepatocytes,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Transcriptomics,在本站被归类为化学诱发性障碍 / 其他。从源站描述来看,该数据集属于一个 SuperSeries,其结构由若干 SubSeries 组成,具体内容需要参考各个 Series 才能获得完整信息。整体而言,该数据集围绕原代小鼠肝细胞在遗传毒性或非遗传毒性致癌物暴露后的 mRNA 与 microRNA 表达谱展开,旨在通过转录组层面的比较分析,揭示不同致癌物暴露条件下可区分的、化合物特异性的响应特征。由于源站仅提供了 SuperSeries 的框架性说明,未给出各 SubSeries 的详细样本信息、实验条件或分析结果,因此本介绍中凡涉及具体数值、指标、结论或未提及内容的部分,均以“源站未提供”说明。

【数据集背景】

该数据集关注的是化学诱发性障碍领域中的一个具体问题:如何区分遗传毒性致癌物与非遗传毒性致癌物在细胞层面引发的分子响应。研究以原代小鼠肝细胞为实验体系,同时考察 mRNA 和 microRNA 两类表达谱,试图从转录组角度捕捉不同致癌物暴露后产生的判别性信号以及化合物特异性信号。源站描述仅说明这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,并提示需参考各个 Series,未进一步提供研究背景、假设或实验设计细节。

【数据内容】

从数据集名称可以了解,其内容涉及 mRNA 表达谱与 microRNA 表达谱两类转录组数据,实验条件涉及遗传毒性致癌物暴露与非遗传毒性致癌物暴露,实验材料为原代小鼠肝细胞。主题标签为 Transcriptomics,表明数据属于转录组学范畴。该数据集以 SuperSeries 形式组织,包含若干 SubSeries,但各 SubSeries 的具体名称、样本数量、分组方式、检测平台、数据文件类型及数据量等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org,本站分类为化学诱发性障碍 / 其他。源站描述指出这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,需参考各个 Series。关于样本采集的具体流程、原代小鼠肝细胞的分离与培养条件、致癌物暴露的剂量与时间、RNA 提取与测序或芯片检测的具体平台、数据产生机构及原始数据存放位置等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于转录组学相关研究场景,尤其是涉及原代小鼠肝细胞、mRNA 与 microRNA 表达谱比较,以及遗传毒性或非遗传毒性致癌物暴露后分子响应差异分析的方向。由于数据集以 SuperSeries 形式组织,使用者可将其作为整体资源,用于探索不同致癌物暴露条件下可区分的表达特征和化合物特异性响应。但具体的适用分析类型、可支持的统计比较或验证用途,源站未提供。

【使用方法】

源站描述提示,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,需参考各个 Series。因此,使用该数据集时,应首先定位并查阅其下属的各个 SubSeries,以获取具体的样本信息、实验条件与数据文件。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法、分析工具或代码等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 omicsdi.org,主题标签为 Transcriptomics,属于化学诱发性障碍 / 其他分类。源站描述仅说明其为 SuperSeries 并需参考各个 Series,未提供关于数据质量评估、批次效应、重复性、覆盖度、测序深度或芯片探针质量等信息。由于缺乏各 SubSeries 的详细说明,无法对数据集的完整性、偏倚风险或适用范围作出进一步判断。相关质量指标与限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、作者信息、发表文献、DOI、数据许可协议或使用条款等内容,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-57132

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below. Refer to individual Series

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