室间隔缺损胎儿心脏组织中失调lncRNA表达的综合分析数据集
该数据集包含室间隔缺损(VSD)胎儿与正常胎儿心脏组织的基因表达数据,模态为转录组层面的非编码RNA(lncRNA)与编码转录本表达谱,通过微阵列技术检测了数万个lncRNA和编码转录本,识别了在VSD中失调的lncRNA,主要用于研究lncRNA在先天性心脏病发生机制中的作用,为心脏发育的分子基础探索提供数据支持。

基本信息
资源简介
室间隔缺损胎儿心脏组织中失调lncRNA表达的综合分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Integrated Analysis of Dysregulated lncRNA Expression in Fetal Cardiac Tissues with Ventricular Septal Defect》。配套论文《Integrated Analysis of Dysregulated lncRNA Expression in Fetal Cardiac Tissues with Ventricular Septal Defect》发表于 PLoS ONE(2013),DOI:10.1371/journal.pone.0077492。源站首次发布:2013-10-16。
【数据内容】
源站原始描述:Ventricular septal defects (VSD) are the most common form of congenital heart disease, which is the leading non-infectious cause of death in children; nevertheless, the exact cause of VSD is not yet fully understood. Long non-coding RNAs (lncRNAs) have been shown to play key roles in various biological processes, such as imprinting control, circuitry controlling pluripotency and differentiation, immune responses and chromosome dynamics. Notably, a growing number of lncRNAs have been implicated i…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个,合计 591.76 KB。Table_S1.doc:application/msword,41.47 KB。Table_S2.doc:application/msword,56.83 KB。Figure_S1.tif:image/tiff,493.46 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0077492。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences、Ecology。主题标签:dysregulated、lncrna、fetal、cardiac、tissues、ventricular、septal。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences、Ecology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Integrated_Analysis_of_Dysregulated_lncRNA_Expression_in_Fetal_Cardiac_Tissues_with_Ventricular_Septal_Defect_/824785
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Song, Guixian; Shen, Yahui; Zhu, Jingai; Liu, Hailang; Liu, Ming; Shen, Ya-Qing; et al. (2016). Integrated Analysis of Dysregulated lncRNA Expression in Fetal Cardiac Tissues with Ventricular Septal Defect. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于先天性心脏病中最常见的室间隔缺损(VSD),通过第二代lncRNA微阵列技术,比较了VSD患儿与正常胎儿心脏组织的转录组谱。数据集覆盖了29,241个lncRNA和30,215个编码转录本,共识别出880个上调与628个下调的lncRNA,并筛选出ENST00000513542和RP11-473L15.2两个与VSD相关的lncRNA。数据来源于心脏组织样本的基因表达分析,旨在揭示lncRNA在VSD发病机制中的作用,为心脏发育与非编码RNA的相互作用研究提供参考资源。
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