GEO GSE109516结节病BAL转录组数据集

GEO GSE109516结节病BAL转录组数据集包含结构化临床变量、诊断编码、实验室指标和随访结局,数据模态为表格,适合结节病相关病例识别、诊断建模、分割检测、风险评估或临床研究复现。

National Center for Biotechnology InformationNational Center for Biotechnology Information
GEO
2018-01-01 更新
浏览 18
表格差异分析GPL173019606
GSE109516 Sarcoidosis BAL Dataset

基本信息

模态
表格
大小
0.033554432 GB
任务类型
差异分析
许可
GEO Data Usage Policy
创建/更新时间
2018-01-01

资源简介

GEO GSE109516结节病BAL转录组数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《The Genomic Research in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency and Sarcoidosis Study (GRADS) Sarcoidosis study [Sarc]》。源站首次发布:Jan 23 201。

【数据内容】

源站原始描述:Whole genome mRNA and microRNA profiling of bronchoalveolar lavage (BAL) and peripheral blood mononuclear cell (PBMC) in Sarcoidosis patients

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL17301、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE109516

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 13 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE109516

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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

GSE109516 Sarcoidosis BAL Dataset 数据集包含结构化临床变量、诊断编码、实验室指标和随访结局,可围绕结节病(Sarcoidosis)开展病例筛选、特征提取、诊断分类、分割检测、风险评估或预后分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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