3C抑制PINK1介导的线粒体自噬并促进柯萨奇病毒B3复制
该数据集包含小鼠病毒性心肌炎模型的单细胞RNA测序、RNA测序、Western blot图像和qRT-PCR等多模态实验数据,主要研究柯萨奇病毒B3感染后病毒蛋白3C通过抑制PINK1介导的线粒体自噬促进病毒复制的分子机制,为病毒性心肌炎的发病机理及治疗策略提供关键数据支持。

基本信息
资源简介
该数据集是一个针对柯萨奇病毒B3(CVB3)感染引起的小鼠病毒性心肌炎(VM)的分子机制研究的综合数据集。数据集主要包括:1)单细胞RNA测序数据,来源于CVB3感染7天后的小鼠心脏组织,使用10× Genomics Chromium系统构建文库并在Illumina Noveseq6000平台上测序;2)RNA测序数据,使用VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit构建文库并进行差异表达基因(DEGs)分析、功能富集分析(GO、Reactome)以及基因集富集分析(GSEA);3)Western blot原始图像;4)qRT-PCR实验数据。数据来源于Balb/c小鼠模型,通过对比感染组与对照组,旨在揭示病毒蛋白3C如何通过抑制PINK1介导的线粒体自噬来促进CVB3复制的分子通路,为病毒性心肌炎的发病机制及潜在治疗靶点提供研究基础。
下载信息
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数据集获取
源站:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=daac166132ac4cc8a23c58115ca3d8dc
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对柯萨奇病毒B3(CVB3)感染引起的小鼠病毒性心肌炎(VM)的分子机制研究的综合数据集。数据集主要包括:1)单细胞RNA测序数据,来源于CVB3感染7天后的小鼠心脏组织,使用10× Genomics Chromium系统构建文库并在Illumina Noveseq6000平台上测序;2)RNA测序数据,使用VAHTS Universal V6 RNA-seq Library Prep Kit构建文库并进行差异表达基因(DEGs)分析、功能富集分析(GO、Reactome)以及基因集富集分析(GSEA);3)Western blot原始图像;4)qRT-PCR实验数据。数据来源于Balb/c小鼠模型,通过对比感染组与对照组,旨在揭示病毒蛋白3C如何通过抑制PINK1介导的线粒体自噬来促进CVB3复制的分子通路,为病毒性心肌炎的发病机制及潜在治疗靶点提供研究基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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