川崎病基因表达与免疫细胞浸润分析数据集
该数据集包含川崎病患者与正常对照的基因表达数据,通过生物信息学方法分析了差异表达基因、免疫细胞浸润及相关性,涉及基因表达和临床表格等多模态信息,主要用于川崎病的生物标志物发现、免疫机制研究和治疗靶点探索,为疾病诊断和治疗提供数据支持。

基本信息
资源简介
该数据集基于GEO数据库中的GSE73461数据集,专注于川崎病(KD)的生物标志物发现和免疫特征研究。数据集包含78名川崎病患者和55名正常对照的基因表达数据,由伦敦帝国理工学院在2015年至2023年间收集。通过生物信息学方法,研究鉴定了差异表达基因(DEGs),并进行了基因本体(GO)和KEGG通路富集分析,揭示了这些基因在急性炎症反应、PI3K-Akt信号通路和细胞因子相互作用中的重要作用。进一步构建了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,识别出AURKB、BUB1、CCL2、IL-4和TOP2A五个候选枢纽基因。利用XCell算法进行的免疫细胞浸润分析显示,川崎病患者中单核细胞、中性粒细胞等免疫细胞水平升高,而B细胞和T细胞减少。相关性分析表明这些候选基因与川崎病的免疫失调和炎症过程相关。该数据集为川崎病的诊断生物标志物和治疗靶点提供了潜在依据,适用于疾病机制、免疫学研究和生物信息学分析等领域。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/Correlation_Heatmap_/29214524
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数据说明
该数据集基于GEO数据库中的GSE73461数据集,专注于川崎病(KD)的生物标志物发现和免疫特征研究。数据集包含78名川崎病患者和55名正常对照的基因表达数据,由伦敦帝国理工学院在2015年至2023年间收集。通过生物信息学方法,研究鉴定了差异表达基因(DEGs),并进行了基因本体(GO)和KEGG通路富集分析,揭示了这些基因在急性炎症反应、PI3K-Akt信号通路和细胞因子相互作用中的重要作用。进一步构建了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,识别出AURKB、BUB1、CCL2、IL-4和TOP2A五个候选枢纽基因。利用XCell算法进行的免疫细胞浸润分析显示,川崎病患者中单核细胞、中性粒细胞等免疫细胞水平升高,而B细胞和T细胞减少。相关性分析表明这些候选基因与川崎病的免疫失调和炎症过程相关。该数据集为川崎病的诊断生物标志物和治疗靶点提供了潜在依据,适用于疾病机制、免疫学研究和生物信息学分析等领域。
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