肥厚型心肌病患者血浆来源细胞外囊泡研究复现数据:意大利队列
该数据集为一项肥厚型心肌病(HCM)研究的复现数据,来源于意大利队列,包含从HCM患者与匹配对照者血浆中分离的细胞外囊泡(EVs)的无标记定量蛋白质组学结果

基本信息
资源简介
肥厚型心肌病患者血浆来源细胞外囊泡研究复现数据:意大利队列
该数据集为一项肥厚型心肌病(HCM)研究的复现数据,来源于意大利队列,包含从HCM患者与匹配对照者血浆中分离的细胞外囊泡(EVs)的无标记定量蛋白质组学结果。EV蛋白经离子淌度增强的数据非依赖采集LC–MSE分析,并使用Progenesis QI for Proteomics处理。数据以单一逗号分隔值文件形式提供,源自Progenesis输出,包含归一化蛋白丰度、统计指标和蛋白注释,可用于HCM相关EV蛋白差异分析及生物标志物探索(来源 doi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):“Investigation of plasma-derived extracellular vesicles in hypertrophic cardiomyopathy patients: insights from an Italian cohort”的复现数据(iScience,修订中)。该数据集包含从意大利队列的肥厚型心肌病(HCM)患者和匹配对照受试者血浆中分离的血浆来源细胞外囊泡(EVs)所获得的无标记定量蛋白质组学结果。EV蛋白通过离子淌度增强的数据非依赖采集LC–MSE进行分析,并使用Progenesis QI for Proteomics进行处理。数据集以源自Progenesis输出的单一逗号分隔值文件形式提供,包括归一化蛋白丰度、统计指标和蛋白注释。包含文件:1. 差异EV蛋白质组数据集 文件:Selected proteins_210525.xlsx 描述:该文件报告了在血浆中鉴定和定量的蛋白质
【主题与分类】
主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、extracellular vesicles、cardiomyopathies。本站分类:心血管系统疾病/肥厚型心肌病。
【获取与许可】
源站页面:https://doi.org/10.13130/rd_unimi/hkxicg
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- OpenDataLab:
数据说明
“肥厚型心肌病患者血浆来源细胞外囊泡研究:来自意大利队列的见解”的复制数据(iScience,修订中)。该数据集包含从意大利队列的肥厚型心肌病(HCM)患者和匹配对照受试者中分离的血浆来源细胞外囊泡(EVs)所获得的定量非标记蛋白质组学结果。EV蛋白质通过离子淌度增强的数据非依赖采集LC–MSE进行分析,并使用Progenesis QI for Proteomics进行处理。该数据集以源自Progenesis输出的单个逗号分隔值文件形式提供,包括归一化蛋白质丰度、统计指标和蛋白质注释。包含文件:1. 差异EV蛋白质组数据集 文件:Selected proteins_210525.xlsx 描述:该文件报告了在血浆来源EVs中鉴定和定量的蛋白质,按以下标准过滤:o 每个蛋白质至少2条独特肽段,o 样本间成功对齐和特征共检测,o 对照组(CTR)与肥厚型心肌病(HCM)组之间的统计比较。
对于每种蛋白质,该文件包含:o UniProt登录号及蛋白质描述,o 肽段计数和唯一肽段数量,o Progenesis生成的置信度评分,o 每个单独样本(技术三重重复)的归一化丰度值,o 组平均值(CTR vs HCM),o ANOVA p值及相应的q值,o 最大倍数变化和统计功效,o 显示最高和最低平均丰度的条件。此数据集可用于重现HCM患者与对照组之间差异蛋白质丰度的统计分析,并支持对肥厚型心肌病中EV相关通路的生物学解释。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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