Ras 依赖性通路诱导回声选择转基因小鼠梗阻性肥厚
该数据集包含通过超声心动图筛选建立的MLC-Ras转基因小鼠亚系模型数据,涉及心脏生理(如超声心动图、腔内压力梯度)、组织病理(心肌纤维排列紊乱)和分子生物学(利钠肽基因表达)等多模态信息,主要用于研究Ras依赖性信号通路在肥厚型心肌病发病机制中的作用,并验证表型筛选在构建精准疾病动物模型中的有效性。
基本信息
资源简介
该数据集来源于一项针对肥厚型心肌病(HCM)的转基因小鼠模型研究。为了克服复杂表型中常见的遗传和个体间变异,研究者通过超声心动图筛选技术,培育出一种具有增强型心室肥厚表型的肌球蛋白轻链(MLC)-Ras(RAS)转基因小鼠亚系。数据集包含对回声筛选小鼠、野生型(WT)动物以及压力超负荷肥厚模型(横向主动脉缩窄;TAC)的比较分析。内容涵盖超声心动图测量(如室壁厚度)、新型微型生理技术检测(如左心室内多普勒速度、腔内压力梯度)、舒张期左心室被动硬度、心肌纤维排列紊乱程度(面积分数)以及左心室利钠肽基因表达模式等。数据来源于公开的生物医学文献(PubMed Central),主要应用于心血管疾病研究领域,特别是用于探索Ras 依赖性信号通路在人类肥厚型心肌病发病机制中的作用,以及验证通过表型筛选建立疾病动物模型的方法。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC20789/
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项针对肥厚型心肌病(HCM)的转基因小鼠模型研究。为了克服复杂表型中常见的遗传和个体间变异,研究者通过超声心动图筛选技术,培育出一种具有增强型心室肥厚表型的肌球蛋白轻链(MLC)-Ras(RAS)转基因小鼠亚系。数据集包含对回声筛选小鼠、野生型(WT)动物以及压力超负荷肥厚模型(横向主动脉缩窄;TAC)的比较分析。内容涵盖超声心动图测量(如室壁厚度)、新型微型生理技术检测(如左心室内多普勒速度、腔内压力梯度)、舒张期左心室被动硬度、心肌纤维排列紊乱程度(面积分数)以及左心室利钠肽基因表达模式等。数据来源于公开的生物医学文献(PubMed Central),主要应用于心血管疾病研究领域,特别是用于探索Ras 依赖性信号通路在人类肥厚型心肌病发病机制中的作用,以及验证通过表型筛选建立疾病动物模型的方法。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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