与肥厚型心肌病相关的循环ceRNA数据集

可用于研究肥厚型心肌病相关的循环ceRNA表达特征,支持差异表达分析与分类建模等任务(来源 NCBI)。源站首次发布:Apr 13 202

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL283879606
GSE148602: Circulating ceRNAs associated with hypertrophic cardiomyopathy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

与肥厚型心肌病相关的循环ceRNA数据集

GSE148602 是一个围绕肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy)开展的循环 ceRNA 表达谱数据集,源站标题为“Circulating ceRNAs associated with hypertrophic cardiomyopathy”,归属于心血管系统疾病 / 肥厚型心肌病方向,数据来自 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集通过人类 ceRNA 微阵列获取血浆样本中的 ceRNA 表达谱,可用于研究肥厚型心肌病相关的循环 ceRNA 表达特征,并支持差异表达分析与分类建模等任务。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE148602_series_matrix.txt.gz,作者为 Qi,Guo,源站首次发布时间为 Apr 13 202。

【数据集背景】

肥厚型心肌病是一种心血管系统疾病,本数据集聚焦于与该疾病相关的循环 ceRNA。ceRNA(竞争性内源 RNA)通过竞争共享的 microRNA 响应元件来调控基因表达,循环 ceRNA 则指存在于血浆等循环体系中的此类 RNA 分子。该数据集以“Circulating ceRNAs associated with hypertrophic cardiomyopathy”为主题,旨在提供与肥厚型心肌病相关的血浆 ceRNA 表达谱信息,为探索循环 ceRNA 在该疾病中的表达特征提供数据基础。源站描述指出,血浆 ceRNA 表达谱是通过人类 ceRNA 微阵列获取的。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE148602_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。该文件为系列矩阵文件,通常用于承载微阵列实验的样本与表达信息。主题标签包括“Expression profiling by array”、平台编号 GPL28387 以及物种编号 9606(即人类)。数据集分类归属于心血管系统疾病 / 肥厚型心肌病。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细的字段说明、样本数量或具体表达矩阵内容。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述明确说明血浆 ceRNA 表达谱是使用人类 ceRNA 微阵列获得的。作者为 Qi,Guo,源站首次发布时间为 Apr 13 202。平台信息以 GPL28387 标识,物种为人类(9606)。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批及具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究肥厚型心肌病相关的循环 ceRNA 表达特征,支持差异表达分析与分类建模等任务。研究者可基于血浆 ceRNA 表达谱比较不同样本间的表达差异,识别与肥厚型心肌病相关的候选 ceRNA;也可将其用于分类建模,探索循环 ceRNA 特征在疾病判别中的潜在价值。此外,该数据可作为心血管系统疾病中 ceRNA 调控研究的参考数据。具体适用性仍需结合样本构成与实验设计判断,源站未提供相关细节。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE148602_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段含义或编码不一致导致的分析偏差。由于该文件为系列矩阵文件,读取后应检查样本信息与表达值组织方式,并结合平台编号 GPL28387 了解微阵列探针注释情况。关于具体的预处理步骤、归一化方法与推荐分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本数量、分组信息、缺失值情况或质量控制指标,因此难以在数据层面全面评估其质量。源站描述仅说明血浆 ceRNA 表达谱通过人类 ceRNA 微阵列获取,未提供实验重复、批次效应或验证实验等信息。此外,发布时间标注为 Apr 13 202,年份信息不完整。使用者在开展差异表达分析与分类建模前,应自行核查数据完整性与适用性。

【引用与许可】

作者为 Qi,Guo,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站首次发布时间为 Apr 13 202。关于该数据集的许可协议、使用条款及推荐引用格式,源站未提供。使用者在引用或再分发数据前,应前往源站查阅相关说明并遵循其要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE148602

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Plasma ceRNA expression profiles were acquired by using a human ceRNA microarray.

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