BMP9与BMP10在内皮细胞中早期磷酸化蛋白质组变化数据集
主题标签:心血管系统疾病、遗传性出血性毛细血管扩张症、内皮细胞、BMP9、BMP10、磷酸化蛋白质组。本站分类:心血管系统疾病/遗传性出血性毛细血管扩张症

基本信息
资源简介
BMP9与BMP10在内皮细胞中早期磷酸化蛋白质组变化数据集
该数据集英文名为 Data from: Deciphering early phosphoproteome changes in response to BMP9 and BMP10 in endothelial cells,来源站为 ebi.ac.uk,由 Yohann Couté 于 2024 年发布,在站内归入心血管系统疾病 / 遗传性出血性毛细血管扩张症分类。数据集围绕内皮细胞在 BMP9 与 BMP10 刺激下的早期磷酸化蛋白质组变化展开,主题标签涵盖心血管系统疾病、遗传性出血性毛细血管扩张症、内皮细胞、BMP9、BMP10 与磷酸化蛋白质组。该数据集为研究 BMP9 和 BMP10 信号在内皮细胞中的早期磷酸化响应提供了可参考的数据资源,适用于与遗传性出血性毛细血管扩张症相关的血管内皮信号传导研究场景。
【数据集背景】
BMP9 与 BMP10 属于骨形态发生蛋白家族成员,在内皮细胞生物学与血管稳态中具有重要作用。遗传性出血性毛细血管扩张症是一种与血管发育和内皮信号异常相关的疾病,BMP9/BMP10 信号通路是该领域关注的方向之一。该数据集以“解析内皮细胞对 BMP9 和 BMP10 响应的早期磷酸化蛋白质组变化”为主题,面向心血管系统疾病与遗传性出血性毛细血管扩张症相关研究,聚焦内皮细胞在受到这两种因子刺激后早期阶段的磷酸化蛋白质组改变。
【数据内容】
数据集主题标签包括心血管系统疾病、遗传性出血性毛细血管扩张症、内皮细胞、BMP9、BMP10 与磷酸化蛋白质组。从名称与主题可以看出,数据内容涉及内皮细胞在 BMP9 和 BMP10 作用下的早期磷酸化蛋白质组变化。具体的样本数量、实验分组、时间点设置、鉴定到的磷酸化位点数目、蛋白质与磷酸肽列表等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述为:Yohann Couté (2024). Deciphering early phosphoproteome changes in response to BMP9 and BMP10 in endothelial cells [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD044952。数据集的作者与发布年份为 Yohann Couté、2024 年。关于具体的细胞来源、刺激条件、质谱平台、样品制备与数据处理流程等采集细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于心血管系统疾病与遗传性出血性毛细血管扩张症相关的基础研究场景,尤其是围绕内皮细胞中 BMP9 与 BMP10 信号传导的早期磷酸化事件分析。研究人员可将其作为内皮细胞磷酸化蛋白质组研究的参考数据,用于探讨 BMP9/BMP10 刺激后早期磷酸化变化的主题分析。具体可支持的统计比较、通路富集或验证实验设计,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档项目页面(PXD044952)提供访问。关于数据文件的具体格式、下载方式、检索方式与分析软件要求,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 Yohann Couté 于 2024 年发布,来源站为 ebi.ac.uk。关于数据质量评估指标、覆盖度、重复性、假阳性控制以及使用中的技术限制等信息,源站未提供。
【引用与许可】
引用信息为:Yohann Couté (2024). Deciphering early phosphoproteome changes in response to BMP9 and BMP10 in endothelial cells [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD044952。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD044952
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Yohann Couté (2024). Deciphering early phosphoproteome changes in response to BMP9 and BMP10 in endothelial cells [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD044952
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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