收缩性心力衰竭肠道微生物组多组学数据集
该数据集来自 doi.org，聚焦慢性收缩性心力衰竭患者的肠道微生物组及其与宿主代谢、免疫反应和疾病严重程度的多组学关联
基本信息
资源简介
收缩性心力衰竭肠道微生物组多组学数据集
Systolic heart failure, gut microbiome, multi-omics dataset
该数据集来自 doi.org，聚焦慢性收缩性心力衰竭患者的肠道微生物组及其与宿主代谢、免疫反应和疾病严重程度的多组学关联。研究纳入非缺血性心肌病所致慢性收缩性心衰成人患者（n=59），采用微生物组宏基因组学、细胞因子谱、非靶向代谢组学、靶向脂质组学和靶向微生物代谢物谱等多组学分析，部分病例含纵向采样，并与健康受试者（n=50）比较。数据含4个文件，包括数据表、数据字典、样本信息表和说明文档，可用于心衰与肠道菌群关系的探索性研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
项目资助方：American Heart Association Career Development Award 856341。源站首次发布：2025-10-28。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：慢性收缩性心力衰竭（HF）是一种常见且致病的疾病，其进展和治疗反应存在显著变异性。肠道微生物组被假设参与HF的病理生理过程，但探索潜在关系的临床研究有限。本研究旨在利用多组学分析研究慢性收缩性HF中的肠道微生物组改变及其与宿主代谢物、免疫反应和疾病严重程度的关联。我们使用多组学分析（包括微生物组宏基因组学、细胞因子谱、非靶向代谢组学、靶向脂质组学和靶向微生物代谢物谱）分析了一组由非缺血性心肌病引起的慢性收缩性HF成人患者（n=59）的肠道微生物组，部分病例进行了纵向采样。与健康受试者（n=50）进行了比较，并关联
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 2.90 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.30422413.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cardiology (incl. cardiovascular diseases)、Microbiology not elsewhere classified。主题标签：heart failure、gut microbiome、gut microbiota、metabolomics、cytokines、multi-omics。本站分类：循环系统疾病/心力衰竭。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cardiology (incl. cardiovascular diseases)、Microbiology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Systolic_heart_failure_gut_microbiome_multi-omics_dataset/30422413
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Mamic, Petra (2025). Systolic heart failure, gut microbiome, multi-omics dataset. figshare. Dataset
下载信息
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源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.30422413
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.9 MB。
数据说明
慢性收缩性心力衰竭(HF)是一种普遍且致病的疾病，其进展和对治疗的反应具有显著变异性。肠道微生物组被认为可能参与HF的病理生理过程，但探索潜在关系的临床研究有限。本研究旨在通过多组学分析，探究慢性收缩性HF中肠道微生物组的改变及其与宿主代谢物、免疫反应和疾病严重程度的关系。我们使用多组学分析(包括微生物组宏基因组学、细胞因子谱分析、非靶向代谢组学、靶向脂质组学和靶向微生物代谢物谱分析)，并对部分病例进行纵向采样，分析了一组由非缺血性心肌病引起的慢性收缩性HF成人患者(n=59)的肠道微生物组。与健康受试者(n=50)进行比较，并评估了与代谢物、炎症标志物和HF严重程度的关联。我们发现，抗炎益生菌双歧杆菌及相关短链脂肪酸产生代谢途径在慢性HF队列中耗竭。
我们还发现了心衰特异性的微生物组-宿主免疫组相互作用。除了鉴定出若干与心衰疾病严重程度广泛相关的分类群和微生物通路外，我们还发现双歧杆菌与临床心衰随时间改善之间存在显著关联。肠道微生物组-宿主多组学数据整合揭示了双歧杆菌与循环代谢物吲哚-3-丙酸之间的密切关联，该代谢物此前已被认为与心血管生理学相关，这提示了双歧杆菌可能影响慢性心衰生理学的潜在机制。我们的研究结果揭示了慢性收缩性心衰中肠道微生物组的深刻变化及其潜在的全身性宿主效应。我们还确定双歧杆菌可作为慢性心衰病程轨迹的潜在生物标志物，并提出基于微生物组的新型治疗策略。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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