二尖瓣转录组分析：34只年龄匹配的伴或不伴黏液瘤性二尖瓣病所致充血性心力衰竭的骑士查理王小猎犬

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA900263

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在此报告一项二尖瓣转录组研究的结果，该研究旨在识别与犬类黏液瘤性二尖瓣疾病（MMVD）后发生充血性心力衰竭（CHF）相关的基因和分子通路。研究聚焦于一个来自单一品种——骑士查理王小猎犬（CKCS）——的高MMVD发病率、年龄匹配的老年犬队列（n=34，年龄约10岁）。该队列包括19只未伴有MMVD相关CHF的犬（10♀，9♂）和15只因MMVD导致CHF的犬（6♀，9♂）。即，我们比较了品种和年龄匹配、仅在CHF状态上有所不同的犬组之间的基因表达。我们识别出56个在两组间差异表达的基因。在这个基因列表中，我们证实了与TNFβ信号通路、细胞外基质组织、血管发育和内皮损伤相关的基因富集，这些也已在先前的研究中被发现。然而，两组间表达差异最大的基因是CNTN3和MYH1。

这两个基因均编码蛋白质，预计会影响心肌细胞的收缩活动，进而可能影响二尖瓣的功能及跨二尖瓣的血流动力学。这可能导致剪切力，从而影响MMVD的进展。总体设计：从犬二尖瓣中分离的总poly-A RNA。该数据集包含来自患有严重黏液瘤性二尖瓣疾病并已进展为充血性心力衰竭（CHF）的病例犬，以及患有较轻黏液瘤性二尖瓣疾病尚未达到CHF阶段的对照犬的RNAseq数据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。