PRJNA763398：野生型与DYRK1B转基因心脏的RNA测序转录谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA763398

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在此，我们研究双特异性酪氨酸调节激酶1B（DYRK1B）对线粒体生物能量学、心肌肥厚及心力衰竭的影响。我们构建了DYRK1B转基因模型，并随后通过RNA-seq分析阐明了DYRK1B及其下游介质的作用。在此数据集中，我们探究了3日龄和8周龄野生型（WT）与DYRK1B转基因心脏的转录谱。总体设计：共分析了十二个样本。最终RNA测序分析包括3日龄WT（n=3）和DYRK1B-Tg（n=3）心脏，以及8周龄WT（n=3）和DYRK1B-Tg（n=3）心脏。基因分型后，收集心脏并立即冷冻于液氮中以便进一步分析。按照标准程序，使用TRIzol试剂提取总RNA，进行逆转录并扩增。测序文库使用BGISEQ-500平台（BGI，武汉，中国）构建。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。