PRJNA1477037:重度高乳糜微粒血症使心脏易发生病理性重构:来自GPIHBP1缺陷小鼠的证据
该数据集包含野生型(WT)与Gpihbp1敲除(Gpihbp1−/−)小鼠心脏组织的bulk RNA测序数据。GPIHBP1缺陷会破坏血管内富含甘油三酯脂蛋白的水解,导致重度高乳糜微粒血症

基本信息
资源简介
PRJNA1477037:重度高乳糜微粒血症使心脏易发生病理性重构:来自GPIHBP1缺陷小鼠的证据
该数据集包含野生型(WT)与Gpihbp1敲除(Gpihbp1−/−)小鼠心脏组织的bulk RNA测序数据。GPIHBP1缺陷会破坏血管内富含甘油三酯脂蛋白的水解,导致重度高乳糜微粒血症。为研究心脏中慢性富含甘油三酯脂蛋白蓄积相关的分子变化,研究者提取心脏组织总RNA并进行高通量转录组测序。这些数据可用于刻画重度高甘油三酯血症背景下与心脏代谢重构、线粒体功能障碍及心力衰竭易感性相关的基因表达改变和生物学通路(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含由野生型(WT)和Gpihbp1敲除(Gpihbp1−/−)小鼠心脏组织生成的bulk RNA测序数据。GPIHBP1缺陷会破坏血管内富含甘油三酯脂蛋白的水解,并导致重度高乳糜微粒血症。为研究心脏中慢性富含甘油三酯脂蛋白蓄积相关的分子变化,从心脏组织中分离总RNA并进行高通量转录组测序。这些数据为刻画重度高甘油三酯血症背景下与心脏代谢重构、线粒体功能障碍和心力衰竭易感性相关的基因表达改变及生物学通路提供了资源。总体设计:为研究Gpihbp1缺陷对小鼠心脏的影响,解剖了野生型(WT)小鼠和Gpihbp1敲除小鼠的心脏。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:循环系统疾病/心力衰竭。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1477037
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1477037
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自野生型(WT)和Gpihbp1基因敲除(Gpihbp1−/−)小鼠心脏组织的批量RNA测序数据。GPIHBP1缺陷会破坏血管内富含甘油三酯的脂蛋白水解,导致严重的高乳糜微粒血症。为了探究心脏中与慢性富含甘油三酯脂蛋白积累相关的分子变化,从心脏组织中分离总RNA,并进行了高通量转录组测序。这些数据为表征在严重高甘油三酯血症背景下与心脏代谢重塑、线粒体功能障碍和心力衰竭易感性相关的基因表达改变和生物学通路提供了资源。总体设计:为了研究Gpihbp1缺陷对小鼠心脏的影响,解剖了野生型(WT)小鼠和Gpihbp1基因敲除小鼠的心脏,提取RNA进行大规模RNA测序研究(每组n = 4)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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