PRJNA1287641：救命左心室辅助装置促进有利于心脏脂肪酸代谢、修复与抗炎的转录组特征
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 1287641），主题为救命左心室辅助装置促进有利于心脏脂肪酸代谢、修复与抗炎的转录组特征，属于循环系统疾病中的心力衰竭方向
基本信息
资源简介
PRJNA1287641：救命左心室辅助装置促进有利于心脏脂肪酸代谢、修复与抗炎的转录组特征
PRJNA1287641 是 NCBI BioProject 数据库中收录的一项生物项目，其完整英文名称为“Life-saving left ventricular assist devices promote a transcriptomic signature favoring cardiac fatty acid metabolism, repair and anti-inflammation”，中文可理解为：救命性左心室辅助装置促进有利于心脏脂肪酸代谢、修复与抗炎的转录组特征。该数据集在分类上归属于循环系统疾病中的心力衰竭方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达。整体来看，该项目围绕左心室辅助装置对心脏转录组的影响展开，关注脂肪酸代谢、组织修复与抗炎反应等方向，属于心力衰竭相关研究中的组学数据资源，可通过 NCBI BioProject 平台获取其关联信息。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1287641。BioProject 是 NCBI 提供的一种生物项目记录形式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据。根据源站描述，一个 BioProject 通常来源于单一机构或联盟，并为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的不同类型数据。该项目的标题表明其研究背景与救命性左心室辅助装置相关，并聚焦于此类装置所促进的转录组特征，这些特征被认为有利于心脏脂肪酸代谢、修复以及抗炎过程。在疾病分类上，该数据集被归入循环系统疾病中的心力衰竭方向，说明其研究语境与心力衰竭的病理生理及治疗机制相关。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目标题进一步指出，研究关注的是左心室辅助装置所促进的转录组特征，并涉及心脏脂肪酸代谢、修复与抗炎等生物学过程。不过，关于具体样本数量、测序平台、基因表达矩阵、差异表达基因列表、统计分析结果等详细数据内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1287641。根据 BioProject 的一般定义，其记录可链接到由单一机构或联盟发起的同一研究计划下产生的多种数据类型。关于本项目的具体采集机构、样本来源、实验设计、时间范围、伦理审批信息等，源站未提供。
【适用场景】
基于其分类与主题标签，该数据集适用于心力衰竭相关研究，尤其是与左心室辅助装置治疗机制、心脏转录组变化、脂肪酸代谢、心脏修复及抗炎反应等方向有关的分析场景。研究人员可能将其用于探索左心室辅助装置作用下基因表达层面的改变，或作为转录组或基因表达数据资源进行二次分析。但具体适用场景需结合源站提供的完整项目信息与数据文件确定，源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 平台访问，项目编号为 1287641。BioProject 记录为用户提供查找同一项目下不同类型数据的统一入口。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或代码等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开数据库中的项目记录。其主题标签与标题提供了研究方向与内容类型的基本信息。然而，关于数据质量评估、样本量、测序深度、批次效应、统计效力、验证实验等具体质量指标，源站未提供。此外，该数据集在分类上属于循环系统疾病中的心力衰竭方向，但具体研究限制与局限性需参考源站原始记录，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1287641，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或版权信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1287641
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在这项研究中，我们对6名终末期心力衰竭患者（3名缺血性心肌病和3名非缺血性心肌病）的心脏样本进行了单核RNA测序。这些患者均接受了左心室辅助装置（LVAD）治疗。在转录组水平上分析LVAD的纵向效应，揭示了一个与糖皮质激素受体相关的共同特征谱，且不依赖于病因。具体而言，突出了四个促进心脏脂肪酸代谢、修复和抗炎作用的基因：FKBP5、ZBTB16、FOXO3和PDK4。总体设计：从6名接受LVAD植入的终末期心力衰竭（HF）患者的左心室心尖部，在植入前和植入后分离细胞核。在本研究中，我们招募了缺血性心肌病（ICM）和非缺血性心肌病（NICM）患者。我们的数据集包括3名ICM患者植入前、3名ICM患者植入后、3名NICM患者植入前和3名NICM患者植入后。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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