人iPSC心肌细胞补片移植改变心肌梗死后细胞外基质与成纤维细胞行为
该数据集来自 NCBI GEO,收录人 iPSC 衍生心肌细胞补片移植到心肌梗死后心脏的相关表达谱数据,包含 1 个文件 GSE318811_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱平台 GPL18694

基本信息
资源简介
人iPSC心肌细胞补片移植改变心肌梗死后细胞外基质与成纤维细胞行为
Human iPSC cardiomyocyte patch transplantation modifies extracellular matrix and fibroblast behavior after myocardial infarction
该数据集来自 NCBI GEO,收录人 iPSC 衍生心肌细胞补片移植到心肌梗死后心脏的相关表达谱数据,包含 1 个文件 GSE318811_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱平台 GPL18694。研究关注补片移植后细胞外基质重塑与成纤维细胞行为变化,涉及胶原 I/III 比例、胶原纤维排列、组织弹性及远端区纤维化等表型。数据可用于分析移植后心脏组织中基因表达差异,探索 TGF-β1 信号与成纤维细胞胶原生成机制,为心力衰竭细胞治疗研究提供转录组层面的参考(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):心肌梗死(MI)后继发慢性心力衰竭是心脏疾病致死的主要原因。尽管使用多能干细胞衍生心肌细胞(CMs)的修复性细胞移植疗法是一种有前景的治疗策略,但其分子机制仍不明确。在此,我们表明,将 hiPSC 衍生 CM 补片移植到 MI 后受损心脏上,可增加 I 型胶原与 III 型胶原的比例,从而调节梗死区胶原纤维的排列。结果,心脏的组织弹性得到改善,远端区的纤维化减少。在机制上,我们发现 hiPSC 衍生 CM 补片分泌 TGF-β1,直接诱导成纤维细胞产生 I 型胶原,但不诱导 III 型胶原。我们的结果表明,移植的 CM 补片对心脏成纤维细胞具有直接作用,
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL18694、10116。本站分类:循环系统疾病/心力衰竭。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318811
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 20 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
心肌梗死(MI)后并发慢性心力衰竭是心脏病致死的主要原因。尽管利用多能干细胞衍生心肌细胞(CMs)进行的修复性细胞移植治疗代表了一种有前景的治疗策略,但该疗法的分子机制仍不明确。在此,我们展示,将hiPSC衍生CM补片移植到MI后受损心脏上,可增加I型胶原与III型胶原的比例,从而调节梗死区胶原纤维的排列。结果,心脏的组织弹性得到改善,远端区的纤维化减少。在机制上,我们发现hiPSC衍生CM补片分泌TGF-β1,直接诱导成纤维细胞中I型胶原的产生,但不诱导III型胶原。我们的结果表明,移植的CM补片对心脏成纤维细胞产生直接作用,改善受损心脏的弹性,从而导致MI后的功能恢复。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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