转甲状腺素蛋白改变心脏成纤维细胞结构、功能与炎症基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE175917

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

年龄相关性野生型转甲状腺素蛋白淀粉样变性（wtATTR）的特征是错误折叠的转甲状腺素蛋白（TTR）形成的淀粉样原纤维在多个器官的结缔组织中系统性沉积。在心脏中，这会导致心功能障碍，是年龄相关性心力衰竭的重要原因。所检验的假设是TTR以可能促进纤维化的方式影响心脏成纤维细胞。当初代心脏成纤维细胞在TTR沉积的基底上培养时，F-肌动蛋白细胞骨架解体，黏着斑形成减少，核形状变扁平。成纤维细胞在TTR沉积基底上的集体迁移和单细胞迁移速度更快。此外，在带有TTR沉积的微柱上培养的成纤维细胞附着减少，且增殖较未处理组增加。对生长在覆盖有TTR的玻璃上的成纤维细胞进行转录组学和蛋白质组学分析显示，48小时后炎症基因显著上调，表明TTR相关疾病的进展。综合来看，结果表明沉积在组织细胞外基质中的TTR可能影响心脏成纤维细胞的结构、功能和基因表达。

由于wtATTR的治疗费用高昂且只能延缓疾病进展，更好地理解细胞适应不良可能有助于阐明新的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。