非人灵长类区域左心室功能的磁共振成像生物标志物表征：重测重复性与个体间变异研究
该数据集基于非人灵长类（如食蟹猴）心脏磁共振研究，用标记和相位对比成像量化左心室收缩泵血与舒张松弛的时空动态，分析旋转力学、心肌应变与心腔血流的时间关系
基本信息
资源简介
非人灵长类区域左心室功能的磁共振成像生物标志物表征：重测重复性与个体间变异研究
Data from: Characterization of regional left ventricular function in nonhuman primates using magnetic resonance imaging biomarkers: a test-retest repeatability and inter-subject variability study
该数据集基于非人灵长类（如食蟹猴）心脏磁共振研究，用标记和相位对比成像量化左心室收缩泵血与舒张松弛的时空动态，分析旋转力学、心肌应变与心腔血流的时间关系。结果显示收缩早期维度主导泵血、晚期扭转主导，舒张早期约65%解旋；峰值应变、平均收缩应变率、E/CSR、E/LSR及减速时间重复性中等至良好，部分指标受试者间变异较高，稳健生物标志物或可用于临床前药物研究（来源 DOI 解析，Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2016。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：临床前动物模型对于研究参与心力衰竭（HF）纵向演变的基本生物学和功能机制非常重要。尤其是，与人类具有更大生理、生化和系统发育相似性的大型动物模型，如非人灵长类动物（NHPs），正日益受到关注。为了评估这些模型向人类疾病的可转化性，影像生物标志物在无创表型分析、下游重构预测以及新型实验性治疗评估中发挥着重要作用。本文通过量化磁共振（MR）影像生物标志物，全面表征左心室（LV）收缩泵血和LV舒张松弛的时空动力学，从而深入揭示NHP心脏功能。MR标记和相位对比（PC）成像被用于量化NHP心脏应变和血流。本文呈现了旋转力学、心肌应变和LV心腔内血流之间的时间相互关系，并通过重测重复性和受试者间变异性分析来评估功能生物标志物。在应变和血流中观察到的时间趋势与已发表的人类数据相似。我们的结果表明，收缩早期存在一种以主导维度为基础的泵血，随后在收缩晚期出现扭转主导的泵血动作。舒张早期以接近65%的解旋为特征，其余解旋可能有助于心房收缩期的高效充盈。我们的数据显示，对于峰值应变、应变率、E/环向应变率（CSR）比值、E/纵向应变率（LSR）比值和减速时间，观察到中等至良好的受试者内重复性。对于应变不同步、舒张期应变率、峰值扭转和峰值解旋率，受试者间变异性较高。我们已成功使用MR成像表征NHP的心脏功能。峰值应变、平均收缩期应变率、舒张期E/CSR和E/LSR比值以及减速时间被确定为稳健的生物标志物，可能可应用于未来的临床前药物研究。
【主题与分类】
主题标签：phase contrast MRI、cynomolgus、Magnetic resonance imaging、cardiac tagging、non-human primates、cardiac function。本站分类：循环系统疾病/心力衰竭。
【获取与许可】
源站页面：https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.6tm5v
使用许可：Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.6tm5v
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 914.2 MB。
数据说明
临床前动物模型对于研究心力衰竭（HF）纵向演变所涉及的基本生物学和功能机制非常重要。特别是，与人类具有更大生理、生化和系统发育相似性的大型动物模型，如非人灵长类（NHPs），正日益受到关注。为评估这些模型向人类疾病的可转化性，影像生物标志物在无创表型分析、预测下游重塑以及评估新型实验性治疗中发挥着重要作用。本文通过量化磁共振（MR）成像生物标志物，全面表征左心室（LV）收缩期泵血和LV舒张期松弛的时空动态，从而为NHP心脏功能提供见解。MR标记和相位对比（PC）成像用于量化NHP心肌应变和血流。本文呈现了旋转力学、心肌应变和LV腔血流之间的时间相互关系，并通过重测重复性和受试者间变异性分析评估功能生物标志物。在应变和血流中观察到的时间趋势与已发表的人类数据相似。我们的结果表明，收缩早期以主导维度变化为基础的泵血为主，随后收缩晚期以扭转主导的泵血作用为主。舒张早期的特征为接近65%的解旋，其余部分可能有助于心房收缩期（atrial kick）的有效充盈。我们的数据显示，峰值应变、应变率、E/周向应变率（CSR）比值、E/纵向应变率（LSR）比值和减速时间观察到中等至良好的受试者内重复性。应变失同步、舒张期应变率、峰值扭转和峰值解旋率的受试者间变异性较高。我们已成功使用MR成像表征NHP的心脏功能。峰值应变、平均收缩期应变率、舒张期 E/CSR 和
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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