GSE109510:转录调节因子CCCTC结合因子限制内皮细胞氧化应激

该数据集来自NCBI GEO,标题为“转录调节因子CCCTC结合因子限制内皮细胞氧化应激”,归入心血管系统疾病/内皮功能障碍

geo
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基因组分类GPL1702110090
GSE109510: The transcriptional regulator CCCTC-binding factor limits oxidative stress in endothelial cells

基本信息

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基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

GSE109510:转录调节因子CCCTC结合因子限制内皮细胞氧化应激

The transcriptional regulator CCCTC-binding factor limits oxidative stress in endothelial cells

该数据集来自NCBI GEO,标题为“转录调节因子CCCTC结合因子限制内皮细胞氧化应激”,归入心血管系统疾病/内皮功能障碍。数据为高通量测序表达谱,含1个文件(GSE109510_series_matrix.txt.gz),平台GPL17021,物种10090。源站描述显示研究聚焦内皮细胞中CTCF对血管发育和活性氧积累的调控,并涉及Fxn基因。可用于内皮功能障碍相关表达谱分析与分类研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 23 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):CCCTC结合因子(CTCF)是一种多功能的转录调节因子,为胚胎发生所必需,但其在血管发育或血管相关疾病中的功能尚不清楚。在此,我们发现内皮细胞中的Ctcf对小鼠血管发育至关重要,并限制活性氧(ROS)的积累。在内皮祖细胞及其后代中条件性敲除Ctcf会影响胚胎生长,并因卵黄囊和胎盘血管发育缺陷导致胚胎第10.5天致死。全基因表达分析显示,在Ctcf缺陷的胎盘内皮细胞中,Friedreich共济失调(FRDA)的突变基因Frataxin(Fxn)是最显著下调的基因。此外,体外报告基因实验表明,Ctcf在内皮细胞中激活Fxn启动子。已知活性氧(ROS)会积累

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL17021、10090。本站分类:心血管系统疾病/内皮功能障碍。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE109510

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 21 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CCCTC结合因子(CTCF)是一种多功能的转录调控因子,为胚胎发生所必需,但其在血管发育或涉及血管成分的疾病中的功能尚知之甚少。在此,我们发现内皮细胞中的Ctcf对小鼠血管发育至关重要,并可限制活性氧(ROS)的积累。在内皮祖细胞及其子代中条件性敲除Ctcf会影响胚胎生长,并因卵黄囊和胎盘血管发育缺陷而导致胚胎第10.5天死亡。全基因表达分析显示,Frataxin(Fxn)——在Friedreich共济失调(FRDA)中发生突变的基因——是Ctcf缺陷胎盘内皮细胞中下调最为强烈的基因。此外,体外报告基因实验表明,Ctcf可在内皮细胞中激活Fxn启动子。已知活性氧(ROS)会在FRDA患者的内皮中积累。重要的是,Ctcf缺陷在体外培养的内皮细胞中以及在体内胎盘内皮中均可诱导ROS介导的DNA损伤。

综上所述,我们的研究结果表明,Ctcf促进血管发育,并限制内皮细胞中的氧化应激,这可能通过激活Fxn转录实现。这些结果揭示了Ctcf–Fxn转录途径在血管发育中的功能,同时也提示了FRDA中内皮功能障碍的潜在机制。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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